近日,沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝學(xué)院李曉楠副教授與河北農(nóng)業(yè)大學(xué)趙建軍教授等國(guó)內(nèi)外科研團(tuán)隊(duì)合作,以共同第一作者身份在《Science》期刊上發(fā)表題為“Gapless pangenome analyses reveal fast Brassica rapa subspeciation”的研究成果。
研究團(tuán)隊(duì)對(duì)1720份十字花科蕓薹屬白菜類作物進(jìn)行了全基因組重測(cè)序,并選取涵蓋7個(gè)亞種的11份代表性材料,完成了高質(zhì)量無間隙基因組組裝。通過整合比較基因組學(xué)與結(jié)構(gòu)變異分析,首次系統(tǒng)闡明了著絲粒結(jié)構(gòu)重塑與大規(guī)模基因組重排共同驅(qū)動(dòng)白菜類作物亞種快速形成的分子機(jī)制。該成果從基因組演化層面為回答達(dá)爾文提出的“被子植物為何能在地球上迅速崛起、并在短期內(nèi)爆發(fā)式多樣化”之謎提供了關(guān)鍵證據(jù)。
李曉楠副教授長(zhǎng)期致力于十字花科作物根腫病抗性與生長(zhǎng)發(fā)育調(diào)控研究。在該研究中,她主要完成了具有突出根腫病免疫特性的蕪菁亞種無縫基因組解析,鑒定了與抗病性和根部形態(tài)建成相關(guān)的大規(guī)模結(jié)構(gòu)變異區(qū)域。
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