摘要:CD8+T 細胞是抗癌抗毒的核心免疫細胞,卻易在癌癥中陷入終末耗竭狀態失去殺瘤能力,而組織駐留記憶 T 細胞能長期護佑機體,二者分子表達相似卻功能相反。研究團隊通過多組學結合Taiji 算法,繪制出 T 細胞命運調控圖譜,發現 ZSCAN20、JDP2 是耗竭特異性轉錄因子,KLF6 為記憶細胞分化關鍵因子,敲除耗竭因子可恢復 T 細胞功能且不影響記憶細胞形成,為精準 T 細胞工程和腫瘤免疫治療開辟新路徑。
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一、抗癌免疫的核心難題:T 細胞的 “冰火兩重天”
CD8+T 細胞是免疫系統里的抗癌主力軍,對抗腫瘤和病毒全靠它的殺瘤能力。但在癌癥這類慢性疾病中,它極易陷入終末耗竭狀態,徹底失去殺傷癌細胞的功能,成了 “躺平” 的免疫細胞。與之相反,組織駐留記憶 T 細胞能在組織中形成長期保護,有效抑制腫瘤生長。有意思的是,這兩種細胞的基因表達模式高度相似,功能卻天差地別,這也成了科研的一大痛點:怎么喚醒耗竭 T 細胞,還不破壞有益記憶細胞的形成?
二、全新研究思路:揪出調控 T 細胞命運的 “基因開關”
為了解開這個難題,研究團隊把目光投向了轉錄因子,這些蛋白正是調控細胞命運的核心開關。團隊整合了 9 種狀態下 CD8+T 細胞的多組學數據,搭建了專屬的分析平臺,還用上了 Taiji 這個特殊算法。這個算法不只是看轉錄因子的表達量,更能評估它在基因調控網絡中的全局重要性,精準找出真正調控 T 細胞命運的關鍵因子,避免了傳統分析的遺漏問題,為后續研究打下了精準的基礎。
三、關鍵發現:兩類轉錄因子,分別掌控耗竭與記憶
通過這份繪制出的轉錄因子圖譜,研究團隊終于厘清了兩種細胞的調控差異。盡管部分調控因子是二者共享的,但ZSCAN20和JDP2這兩個此前未被研究的轉錄因子,被證實是 T 細胞耗竭的特異性驅動因子,而KLF6則是促進 T 細胞向記憶細胞分化的關鍵。在小鼠實驗中敲除編碼前兩者的基因,小鼠和人類的 T 細胞耗竭被有效阻止,殺瘤功能也成功恢復,更驚喜的是,記憶細胞的形成完全沒受影響。
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這份圖譜清晰展現了終末耗竭 T 細胞中的單狀態轉錄因子,也通過體內基因敲除實驗驗證了耗竭因子的關鍵作用,敲除相關基因的 T 細胞,進入耗竭狀態的比例遠低于對照組,直觀證明了這些因子是 T 細胞功能異常的核心原因。
四、小鼠實驗驗證:恢復殺瘤能力,助力免疫治療
在小鼠模型中,針對 ZSCAN20 和 JDP2 的干預手段,不僅讓 T 細胞重新擁有了腫瘤控制能力,還大幅提升了小鼠對免疫治療的響應效果。更關鍵的是,整個過程中組織駐留記憶 T 細胞的形成和功能都沒受到任何損傷。這一結果直接證實,調控 T 細胞耗竭和記憶形成的基因程序是可以被功能解耦的,我們完全能做到精準阻斷細胞功能異常,同時保留機體的保護性免疫,這是腫瘤免疫研究的一大重要突破。
五、臨床轉化的曙光與挑戰
這項研究繪制的轉錄因子圖譜,為精準 T 細胞工程提供了全新藍圖。通過敲除耗竭特異性的基因開關,我們能設計出既保有強大殺瘤能力,又能形成長期免疫保護的工程化 T 細胞。而且這個 “計算 + 實驗” 的研究框架,還能推廣到其他細胞類型,大大加速細胞療法的研發進程。當然挑戰也存在,免疫系統的復雜性讓轉錄因子的功能具有相對性,人類腫瘤微環境的抑制信號,也可能影響工程化細胞的表現,這些都是后續需要攻克的問題。
六、未來研究方向:打造更智能的免疫治療方案
研究團隊接下來的目標,是打造優化的 T 細胞工程 “配方”,把抑制耗竭驅動因子和增強 KLF6 這類記憶促進因子結合起來。同時,借助人工智能技術建模,不斷優化這些因子組合,實現更理性的設計,打造出更智能、更持久的免疫治療手段。從 2019 年研究團隊被這個科學謎題吸引,到跨學科合作碰撞出火花,再到如今的關鍵發現,這場免疫與計算的結合,正為腫瘤治療帶來全新的可能。
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