目前,UKB數據庫相關研究仍不斷出現在高分期刊:
本文整理了醫咖會《UK Biobank介紹及應用研究》專欄對該數據庫數據的描述。正在考慮使用該數據庫的伙伴,可以點擊左下角“閱讀原文”查看完整視頻進一步了解。
UK Biobank(UKB)與常見的老齡化數據庫,比如中國健康與養老追蹤調查CHARLS和美國健康與營養調查NHANES不太一樣,UKB主要調查基線暴露情況與未來結局之間的關聯,理解基因、生活方式、環境在疾病與健康中的相互作用。
基線調查時,UKB全面收集了參與者的數據資料,包括人口學信息、生活方式、體育鍛煉、環境因素(空氣、綠化)等等,同時UKB通過鏈接健康記錄或者直接聯系參與者持續跟蹤健康數據、通過問卷調查獲取認知功能和心理健康狀況,此外還進行了血液、尿液等生物樣本的采集。
這些樣本的采集花費了大量的時間,同樣也獲得了豐富的信息。
常規調查
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眼部數據
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血液生化指標
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代謝組學
UKB包含昂貴的靶向代謝組學數據,以脂質組學為主的定量數據,生物標志物跨越多個代謝途徑,包括了14個亞類中的的脂蛋白和各種低分子量的代謝物。
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蛋白組學
UKB與藥企合作,調查了5萬多名參與者的血漿蛋白質組特質,擁有2000+NPX數據,通過了嚴格質檢,發布后可以直接使用。
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基因分型數據
近年孟德爾隨機化分析備受青睞,其所依賴的GWAS中的大量基因分型數據就來自于UKB。得益于超大樣本量的基因數據,UKB多次登上《Nature》封面。UKB有約45萬人的基因數據可供下載和使用,包括使用定制基因分型芯片850k SNPs和插補基因信息90M SNPs。不同疾病和性狀的GWAS結果在持續公布。外顯子和全基因序列數據可以在UKB-RAP平臺使用分析。
影像數據
已有約10萬人的影像數據可以下載使用。如果不會分析MRI圖像,UKB使用了先進的自動化機器學習算法,計算了數千個可以直接使用的圖像衍生表型,包括全腦體積、海馬體積等等。
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健康相關結局
UKB健康結局并不是來源于自我報告,而是鏈接英國國家衛生系統(NHS)數據庫進行實時更新(半年-1年進行一次更新),目前已有大量死亡、癌癥及其他健康結局數據,通過ICD9和ICD10可以區分超過1000種疾病,預計未來會有更多的可用數據,助力研究者獲得陽性結果。
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