綜述寫作必備！生物網站+生信網站

工欲善其事，必先利其器！好的工具網站可以為科研提供很大的助力。寫綜述有助于快速掌握該領域的最新進展；識別研究空白與趨勢，為研究開題提供研究選題和方向的參考。當然，綜述寫作必須站在一定高度，才能做出精練總結，對爭議發表深刻見解。我們可以結合既往文獻和公共數據挖掘，我們梳理了一些生物網站和生信網站。

網址：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/

醫藥生物相關研究，必不可少的當然是NCBI了，基因、蛋白等生物功能信息和科學文獻全都有。Gene，Genome，Nucleotide等可以查到目的基因的基本分子遺傳信息，通過Protein看蛋白的生化性質，GEO數據庫收錄了全球研究機構提交的高通量基因表達數據，進行生物信息學分析可以從這里下載到各種基因表達信息。

網站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/

PubMed文獻檢索工具，海量的生物醫學研究論文都能從這個網站搜索下載。

網址：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/

蛋白研究必不可少的數據庫，UniProt！可以查詢到蛋白基本的生物學信息，比如蛋白序列和大小，蛋白在細胞中的定位和功能、結構、蛋白酶的酶活位點等等多物種蛋白質的生化信息。同時，還有肽段Blast以及序列比對等功能。

網址：https://www.uniprot.org/

人類基因數據庫GeneCards，這是可以全面查看基因相關信息的非營利性網站，而且網站是一直在積極維護的，目前更新到5.1版本，不僅有編碼蛋白基因的信息，還包含有大量非編碼RNA的信息。網站整合上百個網站的數據信息，提供很全面的基因信息。直接輸入想了解的基因后，可以看到各個特征，如：Disorders，Domains，Drugs，Expression，Pathways等基本的基因的生物學特征。

網址：https://www.genecards.org/

要查詢蛋白在組織中的表達信息，可以使用The Human Protein Atlas網站。這一網站與UniProt有很多相似的功能，可以看蛋白基本的生化特征和基因信息，還可以從不同層面去看蛋白的表達和分布，而且有圖有真相！

網址：https://www.proteinatlas.org/

要查詢基因在染色體上的位置以及啟動子、增強子等基因表達調控相關元件，可以使用UCSC網站獲取。首先可以在Genome菜單下選取查詢的數據庫，然后輸入要查詢的基因名即可，簡單方便。

隨后會出來下面的基因圖譜，最下方還有可以勾選的各種基因特征的展示選項，看自己需求添加要看的內容，功能強大且信息全面，是了解基因表觀特征及表達不可或缺的神器！

網址：https://www.proteinatlas.org/

DepMap網站可以搜索基因、細胞系、化合物的信息。以細胞搜索為例，可以檢索到細胞系的來源和基因層面的特征，還包括可能會轉移的位置。對于藥物的信息也比較全面，可以看在不同細胞中的作用濃度，以及不同細胞對藥物的敏感度、受藥物影響的基因等。

網址：https://depmap.org/portal/

TRRUST可以查找人源和鼠源轉錄因子的基因調控網絡，可以正向搜索也可以反向搜索，需要注意選好對應的物種。進入后可以看到具體的調控關系：轉錄激活還是轉錄抑制，還能夠看到檢索蛋白所涉及疾病和信號通路信息。

網站：https://www.grnpedia.org/trrust/

以上主要是生物網站，生信網站的話，我們以前分享過，有40多個。

我們以CD73為例，做個簡單的呈現。

CD73在肺癌中的表達

CD73表達與預后

CD73與腫瘤微環境

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