Synthesis Bio獲1000萬(wàn)美元種子輪融資加速生成基因組學(xué)

Synthesis Bio是一家開(kāi)創(chuàng)性生物基礎(chǔ)模型以模擬基因表達(dá)實(shí)驗(yàn)結(jié)果的生物技術(shù)公司，宣布獲得由Madrona牽頭的1000萬(wàn)美元種子輪融資，參與者包括Sahsen Ventures、Inner Loop Capital、Point Field Partners和AI2孵化器。這筆資金將加速Synthesis Bio生成基因組學(xué)模型的開(kāi)發(fā)，并擴(kuò)大生物制藥公司和研究人員的獲取途徑。

“生物制藥公司需要豐富、有代表性的數(shù)據(jù)來(lái)識(shí)別新的藥物靶點(diǎn)，驗(yàn)證藥物安全性和有效性，并為基礎(chǔ)模型提供動(dòng)力。我們的模型幫助科學(xué)家預(yù)測(cè)新的和目前暫不可能的實(shí)驗(yàn)的結(jié)果，以更快、更具成本效益地推進(jìn)他們的科學(xué)。”Synthesis Bio的聯(lián)合創(chuàng)始人Rob Bradley博士說(shuō)。

Synthesis Bio已經(jīng)構(gòu)建了生成式表達(dá)式模型-1（GEM-1：Generate Expression Model-1），這是一個(gè)生成基因組學(xué)基礎(chǔ)模型，基于有史以來(lái)最深入構(gòu)建的數(shù)據(jù)集之一RNA-seq進(jìn)行訓(xùn)練。該公司最近的出版物證明了GEM-1能夠直接從實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)描述中生成與濕實(shí)驗(yàn)室（是指進(jìn)行涉及液體、化學(xué)品、生物樣本等“濕”材料實(shí)驗(yàn)的實(shí)驗(yàn)室）實(shí)驗(yàn)相匹配的計(jì)算機(jī)數(shù)據(jù)。這一成就代表了“生成基因組學(xué)”的新范式，其中高保真生成式模型增強(qiáng)了實(shí)驗(yàn)室結(jié)果，預(yù)測(cè)了未來(lái)的實(shí)驗(yàn)結(jié)果和臨床試驗(yàn)結(jié)果，并最終加速創(chuàng)新。

Synthesis Bio由Rob Bradley博士和Jeff Leek博士創(chuàng)立，使研究人員能夠加速藥物發(fā)現(xiàn)和其他依賴于基因表達(dá)數(shù)據(jù)的應(yīng)用，而不受實(shí)驗(yàn)室或臨床數(shù)據(jù)集稀缺或偏見(jiàn)的限制。

Leek博士是J Orin Edson基金會(huì)癌癥中心的主席兼首席數(shù)據(jù)官，他的工作重點(diǎn)是RNA信息學(xué)。他率先做出了重大努力，將來(lái)自全球研究人員的不同RNA數(shù)據(jù)集組裝、歸一化和組合成最大的組合數(shù)據(jù)集。他因?qū)┌Y中心聯(lián)合起來(lái)整理歸納患者數(shù)據(jù)而被列入《時(shí)代人工智能100 2025》榜單。

Bradley博士是McIlwain家族捐贈(zèng)主席，也是Fred Hutchinson癌癥中心轉(zhuǎn)化數(shù)據(jù)科學(xué)綜合研究中心主任。他的研究表明，RNA失調(diào)是癌癥發(fā)病的常見(jiàn)原因，并確定了治療這些癌癥的新療法。

Madrona董事總經(jīng)理Matt McIlwain表示：“Madrona的投資建立在我們長(zhǎng)期以來(lái)在人工智能和生命科學(xué)交叉領(lǐng)域的理論基礎(chǔ)上。我們相信Synthesis Bio代表了生物制藥和研究人員如何有效地發(fā)現(xiàn)和開(kāi)發(fā)新療法的變革性轉(zhuǎn)變。”“Rob、Jeff和團(tuán)隊(duì)擁有將生成基因組學(xué)付諸實(shí)踐的獨(dú)特能力，我們很高興能與他們合作。”

bioRxiv上提供的預(yù)印本中描述了Synthesis Bio第一代基礎(chǔ)模型的性能。它描述了GEM-1對(duì)訓(xùn)練數(shù)據(jù)截止后進(jìn)行的實(shí)驗(yàn)室實(shí)驗(yàn)結(jié)果的成功預(yù)測(cè)，以及來(lái)自大型臨床隊(duì)列的人工智能數(shù)據(jù)生成，首次表明完全在計(jì)算機(jī)上進(jìn)行的新研究可以產(chǎn)生與濕實(shí)驗(yàn)室或臨床試驗(yàn)相當(dāng)?shù)慕Y(jié)果。

Synthesis Bio團(tuán)隊(duì)正在與生物制藥團(tuán)隊(duì)建立合作伙伴關(guān)系，利用他們的基礎(chǔ)模型加速藥物開(kāi)發(fā)。這些合作伙伴關(guān)系利用該公司的基礎(chǔ)模型來(lái)降低整個(gè)臨床流程的風(fēng)險(xiǎn)，從確定高置信度目標(biāo)到模擬治療反應(yīng)和優(yōu)化臨床試驗(yàn)設(shè)計(jì)。GEM-1基礎(chǔ)模型的訪問(wèn)現(xiàn)在可以在Synthesis Bio以及通過(guò)R和Python API客戶端訪問(wèn)。

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