日本原住民“早萬年”，為啥不對勁？

看到一句話

• 絕大多數中國人也許也不知道日本最原始的原住民遠比現代中國人的祖先早上萬年就通過海洋遷徙到東亞（一類編號YAP的原始基因在日本人基因測序里有三分之一而在中國人里低于1%）。

第一直覺就是有問題，因為在分子人類學上，日本還是比較明確的，既然走出非洲理論大家都認可，那么作為東亞一個孤懸小島上的人難道是飛過去的？還是土地里長出來的？

01，日本原住民“早萬年”，為啥不對勁？

第一，時間搞錯了。我恰恰有這篇文章。這個文章論證的是日本人的一部分基因是在來自于一萬年左右進入日本島的繩文人。

而中國人進入東亞時間大概是5萬年前。所以不存在日本比中國還早1萬年的說法！

第二，地理位置錯位。論文其實說的是日本島的問題，雖然日本屬于東亞，但是東亞不等于日本。所以在這個問題上，還是要慎重的說

第三，關于基因比例的問題。日本人YAP多是絕對不能證明日本人早的，反過來這恰恰說明了兩個問題。日本人群體太小，所以基因始終無法得到稀釋。

而其他地方的群體太過龐大，所以很多突變很快會通過群體擴散最后變得很低了。事實上在生物學上，一個典型的問題就是建立者效應。

建立者效應（founder effect，亦稱為奠基者效應、建立者效應或創始者效應、始祖效應）是遺傳漂變的一種形式，指由帶有親代群體中部分等位基因的少數個體重新建立新的群體，這個群體后來的數量雖然會增加，但因未與其他生物群體交配繁殖，彼此之間基因的差異性甚小。這種情形一般發生于對外隔絕的海島，或較為封閉的新開辟村落等。也可稱“定殖者效應”。

日本這種海島，恰恰符合這個特點，由于孤懸海外，只有部分人可以從大陸遷徙到日本，于是這少部分人成了日本人的祖先，也就是建立者效應，他們的后代由于種群太少，多樣性也小，于是基因擴散很難。

而相反，對于大陸，由于人群遷徙特別頻繁，還經常跟其他民族交流，所以這些基因頻率淘汰得非常快。

02，文章解讀

這篇文章題目是Y Chromosomal DNA Variation and the Peopling of Japan，發表于1995年，AJHG，這個期刊倒是業內比較知名，屬于專業期刊，是我們做分子人類學的top1（當然你要是更吊的話就發到了nature science了，比如金力教授關于漢族遷徙的就發到了nature）

首先說一下，1995年的時候，人類基因組還沒測呢！畢竟那個時候測序技術太不成熟了，后來大師venter 搞出的新技術才讓我們有了更加方便的測序。另外，作者測的是一個基因多態性，叫做 Y Alu polymorphic (YAP) element

那么作者得出了啥結論呢？首先，作者檢測了沖繩，本州島的靜岡和青森兩個地方，以及臺灣這四個地方。然后呢，發現這四個地方里，有42%的日本人有YAP，而臺灣人沒有——結論是這個YAP在亞洲人分布是不規則的（否則大家都有了）。

這是取樣的大體位置

其次，他算了下遺傳距離，通過遺傳距離，他計算出，沖繩人和來自于本州（靜岡和青森）的日本人是不一樣的！

這是分布圖，括號里是百分比，我們可以看到

1、臺灣人明顯和日本人不一樣，臺灣人經常是100,

2、日本內部，沖繩和本州明顯不一樣，比如第一個YAP，沖繩是56%，本州是34%

最終他得出的結論是，現代日本人的基因貢獻來源是多樣的，包含了

1、古代繩文人（一萬年前，來自于中國）

2、彌生時代（秦漢時期-200~200年）來自于朝鮮半島或者中國大陸的移民，而沖繩人應該和彌生時代的人有一定的交集。作者推測，攜帶有YAP的人大概在繩文時代（1萬年左右）進入日本人，而大量的無YAP人大概在2300年前的彌生時代進入了日本。

作者最后說，這些差異可能跟以下因素有關

1，遷徙群體

2，建立者的規模

3，建立者效應的古代史

4，生活方式，比如繩文人的采集狩獵和彌生人的農業文化。

整篇文章明明就說了一個事情，日本人的基因來源多樣性，比如沖繩就特殊，而且還保留著繩文時代遷徙而來的人的基因部分。這完全就不是用來比較日本人和中國人的啊！而且作者提到了彌生時代非常大規模的來自于中國大陸或者朝鮮半島的人類遷徙。

03，關于這篇文章的意義

這篇文章是用來解讀日本本土人來源的。在作者之前，關于日本人起源，日本主流有三種觀點：

1、現代日本人來自于3萬年前的亞洲大陸，那個時候日本海島還連接著大陸

2、日本來自于1萬年前，即繩文人，主要是陶瓷和狩獵文化

3、日本人來自于2300年前，即彌生文化，通過朝鮮半島，帶來了編織技術、金屬制造和水稻技術。彌生文化最早發現于九州，然后很快覆蓋全日本島，甚至導致了北海道南部的文化徹底改變。

而大家在爭議古代繩文人對日本的基因貢獻有多少。這里又有兩種理論

一種叫做替代（substitution），即后來人把前人替代了，

一種叫做轉換（transformation），即現代日本人是最初在更始世（一萬二千年以前）從中國南部來到日本，然后在本土獨自的發展。

而作者提出了一種新的看法，叫做雜交（hybridization），認為現代日本人是不同批次遷徙到日本的人的混合體。

04，聊聊一些不太嚴謹的說法

還有一些其他說法，似乎并不嚴謹。

歐洲人意識到自己并不是尼安德特人的子孫后代

no，事實上嚴格意義上，現代人是智人和尼安德特共同的后裔。

中國人意識到自己作為智人而跟北京猿人并沒有什么傳承關系

no，這個目前還有待研究。因為我們目前還沒有檢測到中國的古人類基因。出現一個中國本土的“尼安德特人”是非常有可能的（類似于丹尼索瓦人），即現代人到了中國和當地的古人類進行了混合，由于中國大陸不太適合保存古人類，所以研究比較滯后，而歐洲做的非常好。

事實上現代人類學證明，現代智人是從非洲走出后，他們和各地的古人類進行了雜交并產生了后代。

現代基因圖譜的測定表明斯拉夫人遠比德國人擁有“更純的雅利安人血統”，從而響亮打了幾十年前納粹德國人種優

no！推翻這個的明顯是考古學的功勞而非分子人類學。因為德國人口中的“雅利安人”（金發碧眼）和真實的雅利安人是兩碼事，這屬于納粹搞錯了日耳曼人本質，給自己的爹強行取了個雅利安的名字而已，根本不存在誰是純種的問題。

這是歐洲的y染色體，咋看純度？

發現DNA與遺傳物質的真相真的是人類最偉大的發現之一，它極大的完善了進化論，并成為依靠考古挖化石的方法之外，支持進化論的又一個堅實的論證。

no，搞錯人了，完善進化論的是木村資生的中性進化論，對其貢獻巨大的人包括：

1，孟德爾和摩爾根的現代遺傳學 2，沃森和克里克的DNA雙螺旋，他倆都不是發現DNA的！

請問在座的各位有幾個知道誰發現了dna？進入教科書的人叫艾弗里，不過他不是發現DNA的，而是證明DNA是遺傳物質的。答案是1869年,是瑞士生物學家Friedrich Miescher發現的（我也是百度加谷歌找到的這尊）。

ref.

Hammer M F, Horai S. Y chromosomal DNA variation and the peopling of Japan[J]. American journal of human genetics, 1995, 56(4): 951.

最后，很多人不太清楚時間點。

1，一代測序是上世紀70年代才搞出來的

2，人類基因組計劃是2001年才完成的，在這之前，我們不清楚人類整體基因的情況，而這個計劃過程中venter和各國科學家組成的兩個團隊互相印證，最后才確定了二代測序。

3，人類走出非洲是1987年才提出的，根據的是線粒體DNA