衰老長期以來被視為身體自然磨損的結果,但最新研究卻提出了一個顛覆性的觀點:衰老并非單純的“磨損”,而是一種由“泄漏”引發的內在過程。2025年9月,Nature期刊發表題為Ribonucleotide incorporation into mitochondrial DNA drives inflammation的研究論文。該研究發現,核苷酸失衡使核糖核苷酸錯誤摻入mtDNA,導致mtDNA不穩定并激活免疫反應,引發衰老相關分泌表型(SASP)。該過程可通過外源性補充脫氧核苷酸抑制,并進一步揭示核苷酸代謝失衡在衰老和炎癥反應中起關鍵作用。
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一、差異表達:揭示炎癥的遲發性激活
通過NanoString轉錄組分析,作者發現Mgme1?/?小鼠在70周齡時表現出干擾素刺激基因(ISG)的顯著上調,而在年輕小鼠(10–55周)中未觀察到類似變化,表明ISG上調并非一開始就發生,而是隨著年齡積累,逐漸激活。這揭示了一個非常有趣的現象:衰老引起的免疫表型是一個遲發性反應,隨著時間的推移才逐漸顯現。這種免疫反應在全身范圍內普遍存在,包括腎臟、肝臟、心臟和肌肉等多個組織。通過數字PCR技術,發現Mgme1?/?小鼠胞質中mtDNA顯著積累,推測線粒體DNA外泄激活cGAS–STING通路,觸發慢性炎癥,提示基因缺失在時間積累下轉變為慢性免疫反應的驅動因素。(如圖1)
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二、差異影響表型:STING通路的核心作用。
為了驗證Mgme1缺失引發的免疫反應的分子機制,研究團隊構建了雙基因小鼠模型(Mgme1?/?與Mgme1?/?Sting1mut/mut),進一步驗證了STING通路的核心作用。NanoString轉錄組分析顯示,Mgme1?/?小鼠腎臟中ISG顯著上調,而在STING缺失小鼠中,這一上調幾乎完全消失,表明STING是Mgme1缺失誘導免疫反應的核心介質。在Mgme1缺失的細胞(MEFs)中,線粒體DNA外泄明顯,而STING缺失小鼠無法激活免疫反應。PAS染色與免疫組化實驗發現,Mgme1?/?小鼠的腎小管硬化與免疫細胞浸潤顯著,而STING突變小鼠中的這些損傷得到緩解。這一系列實驗揭示了Mgme1缺失→mtDNA外泄→STING激活→炎癥與組織損傷的完整機制鏈條。這一發現暗示衰老相關的慢性炎癥可能源自細胞內部的遺傳物質泄漏,而非外源感染。(如圖2)
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三、機制探討:mtDNA復制缺陷與免疫激活
研究團隊通過siRNA下調mtDNA復制相關酶,發現抑制mtDNA復制酶時,ISG表達顯著升高,提示mtDNA復制缺陷可能觸發STING依賴的免疫反應。dPCR和LC-MS分析顯示,Mgme1缺失小鼠中dNTP水平顯著下降,影響了mtDNA復制穩定性。下一代測序分析發現,Mgme1缺失阻礙了mtDNA復制起始位點的啟動,Mgme1缺失導致mtDNA復制起始位點受阻。這些結果表明,dNTP缺乏與mtDNA復制障礙共同作用,最終激活了cGAS–STING通路,引發免疫反應。這一機制的揭示,不僅解釋了Mgme1缺失如何通過影響dNTP合成和mtDNA復制激活免疫信號通路,也為開發免疫抑制藥物或線粒體保護策略提供了理論支持。(如圖3)
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四、轉化探索:核糖核苷酸不平衡與mtDNA復制不穩定
進一步研究使用LC-MS和HydEn-seq技術分析Mgme1?/?與Yme1l?/?小鼠細胞中的rNTP和dNTP水平變化,發現rNTPs(如rA、rG)顯著升高,尤其是在mtDNA中,提示核糖核苷酸不平衡影響mtDNA穩定性。Southern雜交和RNase H2處理驗證了rNTP的過度摻入,導致mtDNA不穩定,并激活STING通路。結合dNTP水平下降的發現,研究揭示了dNTP不足如何導致mtDNA復制缺陷并激活免疫反應。最終,研究將這一機制與線粒體功能障礙和免疫系統激活聯系起來,為抗衰老與免疫抑制治療策略的研發提供了理論支持。此研究不僅闡明了核糖核苷酸不平衡與mtDNA復制不穩定如何激活免疫反應,還提出rNTPs過度摻入可能成為衰老及相關免疫疾病的重要機制。
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五、從基礎機制到臨床轉化:核苷酸代謝紊亂的可干預性
研究通過輻射誘導的衰老IMR90細胞和體外實驗,篩選出rNTP與dNTP比例失衡對mtDNA穩定性和免疫反應的影響。外源性脫氧核苷酸補充實驗驗證了代謝紊亂與衰老相關炎癥的可干預性。研究表明,補充脫氧核苷可以恢復dNTP水平,抑制mtDNA外泄及相關免疫炎癥,為抗衰老和免疫調節提供新思路。進一步分析發現,衰老細胞中rNTP異常摻入通過激活cGAS–STING途徑,顯著增強SASP。外源補充脫氧核苷成功逆轉這一過程,提出了通過恢復核苷酸平衡抑制衰老相關免疫反應的治療策略。(如圖5)
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六、重新定義衰老的科學意義
圖6揭示了衰老過程中dNTP池枯竭和rNTP積累的關鍵作用。核苷酸池失衡導致rNMPs摻入mtDNA,引發mtDNA不穩定和斷裂,最終通過mtDNA泄漏激活免疫反應,維持SASP。補充dNTPs可逆轉這一過程,證明該機制在衰老中起重要作用。這一發現挑戰了傳統的衰老理解,提出衰老不僅是外部磨損,更是內部代謝紊亂引發的免疫激活。恢復核苷酸代謝平衡或為抗衰老和免疫調節治療提供新路徑。(圖6)
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文章最后的十張擴展數據圖共同構建了一個完整且堅實的證據鏈。
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首先,通過定義表型(擴展數據圖1),揭示MGME1缺失引發的炎癥反應和線粒體損傷;接著,通過驗證通路(擴展數據圖2, 3),證明炎癥反應是通過cGAS-STING-TBK1通路介導的;隨后,闡明機制(擴展數據圖4, 5),展示cGAS定位變化及mtDNA外泄是激活該通路的信號源;進一步深入挖掘(擴展數據圖6, 7, 8),發現復制過程、核苷酸池平衡和POLγ抑制是導致炎癥的上游根源;最后,通過提升意義(擴展數據圖9, 10),在衰老模型和多種組織中進行了驗證,證明這一機制具有廣泛的生理相關性。
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