編者按:靶向蛋白降解劑(TPD)通過利用細(xì)胞自身的蛋白降解系統(tǒng)降解與疾病相關(guān)的靶蛋白。由于無需直接抑制靶蛋白的活性,這種治療模式有望針對(duì)許多以往被認(rèn)為“不可成藥”的靶點(diǎn),因而成為新藥開發(fā)的熱點(diǎn)領(lǐng)域之一。早在近10年前,這項(xiàng)技術(shù)剛剛起步時(shí),藥明康德就開始布局相關(guān)能力和技術(shù),積累了豐富的成功經(jīng)驗(yàn),搭建起集發(fā)現(xiàn)、合成、分析純化和測(cè)試等能力的一體化賦能平臺(tái)。目前,該平臺(tái)已成功支持超過120款TPD分子的開發(fā),其中20余款順利推進(jìn)至臨床階段。今年,TPD領(lǐng)域的前沿研究收獲頗豐:多款新型TPD技術(shù)誕生,發(fā)展迅速的PROTAC與分子膠技術(shù)也迎來了治療場(chǎng)景的突破。本文將回顧2025年上半年TPD領(lǐng)域的最新進(jìn)展。
從癌癥到抗衰:PROTAC新前沿
蛋白降解靶向嵌合體(Proteolysis Targeting Chimeras,簡稱PROTAC)是TPD領(lǐng)域最具代表性的技術(shù)之一,它由靶蛋白配體、E3泛素連接酶配體和連接鏈(Linker)三個(gè)關(guān)鍵部分組成。當(dāng)PROTAC同時(shí)結(jié)合目標(biāo)蛋白和E3連接酶時(shí),E3酶會(huì)催化靶蛋白的多泛素化,使其被蛋白酶體識(shí)別并降解。
這種特殊作用機(jī)制賦予了PROTAC獨(dú)特優(yōu)勢(shì):它不需要長時(shí)間占據(jù)靶蛋白活性位點(diǎn),只需短暫結(jié)合蛋白表面即可誘導(dǎo)其降解。這一特性使其能夠靶向缺乏明確活性位點(diǎn)的蛋白,包括轉(zhuǎn)錄因子、支架蛋白和突變體蛋白等傳統(tǒng)"不可成藥"靶點(diǎn)。過往的研究中,PROTAC技術(shù)已經(jīng)在腫瘤領(lǐng)域嶄露頭角,尤其在解決耐藥性和免疫微環(huán)境調(diào)控方面表現(xiàn)出巨大應(yīng)用潛力。
![]()
今年上半年,PROTAC的臨床領(lǐng)域迎來里程碑式進(jìn)展:首個(gè)PROTAC分子3期結(jié)果發(fā)布,vepdegestrant在攜帶ESR1突變的HR陽性、HER2陰性乳腺癌患者中,將患者的疾病進(jìn)展或死亡風(fēng)險(xiǎn)降低超過40%。Arvinas和輝瑞近日已經(jīng)向美國FDA遞交vepdegestrant的新藥申請(qǐng)(NDA)。與此同時(shí),PROTAC領(lǐng)域的前沿研究也取得了一系列突破性進(jìn)展。伴隨著對(duì)分子與細(xì)胞機(jī)制的探索,多款具有癌癥、衰老相關(guān)疾病治療潛力的PROTAC分子初露鋒芒。
例如,不久前的一項(xiàng)《自然》研究發(fā)現(xiàn),STAT3蛋白會(huì)削弱樹突狀細(xì)胞的抗原呈遞能力和T細(xì)胞活化功能,制約這類細(xì)胞在免疫檢查點(diǎn)阻斷治療(ICB)中的功能。為了解決這一問題,研究者開發(fā)了兩種新型STAT3靶向PROTAC分子SD-36和SD-2301。這些PROTAC分子能特異性誘導(dǎo)STAT3蛋白的泛素化降解,激發(fā)樹突狀細(xì)胞的抗癌潛能。在多種小鼠腫瘤模型中,SD-36或 SD-2301單藥治療就顯示出顯著療效,不僅能有效抑制腫瘤生長,還能克服ICB耐藥問題。機(jī)制研究表明,STAT3降解后樹突狀細(xì)胞的共刺激分子表達(dá)顯著上調(diào),CD8+T細(xì)胞浸潤增加。SD-36、SD-2301與抗PD-L1抗體聯(lián)用,還可顯著增強(qiáng)療效。
![]()
另一項(xiàng)《分子細(xì)胞》研究設(shè)計(jì)了一種靶向NSD3S的PROTAC分子。研究指出,當(dāng)特定的泛素連接酶復(fù)合物調(diào)控出現(xiàn)故障,導(dǎo)致NSD3S蛋白水平異常升高,就會(huì)引發(fā)癌細(xì)胞對(duì)PARP抑制劑的耐藥性。而在多種前列腺癌模型中,這款PROTAC能夠有效恢復(fù)腫瘤細(xì)胞對(duì)抗癌藥物PARP抑制劑的敏感度,為前列腺癌提供了新的聯(lián)合治療思路。
除了癌癥,PROTAC技術(shù)也有望在衰老相關(guān)疾病中“施展拳腳”。今年1月,《自然-衰老》的一項(xiàng)研究展示了一種新型雙靶點(diǎn)PROTAC分子753b,能夠同時(shí)降解BCL-xL和BCL-2這兩個(gè)關(guān)鍵的抗凋亡蛋白。在代謝功能障礙相關(guān)脂肪性肝炎(MASH)小鼠模型中,753b治療選擇性地清除了肝臟中的衰老細(xì)胞,使纖維化面積減少60%以上。更重要的是,在MASH驅(qū)動(dòng)的肝癌模型中,753b能通過清除衰老細(xì)胞使肝癌發(fā)生率降低80%,治療性干預(yù)也能顯著抑制腫瘤進(jìn)展。
為了確保PROTAC分子發(fā)揮出強(qiáng)大功能,科學(xué)家們一直在嘗試提升其細(xì)胞內(nèi)遞送效率。一項(xiàng)發(fā)表于《細(xì)胞》的研究顯著提升了對(duì)相關(guān)機(jī)制的認(rèn)知。通過創(chuàng)新的探針技術(shù),該研究首次鑒定出CD36是多種PROTAC分子的內(nèi)吞受體。研究發(fā)現(xiàn),多個(gè)PROTAC以及雷帕霉素等大分子藥物,都能通過CD36依賴的內(nèi)吞途徑進(jìn)入細(xì)胞。在精確定位PROTAC分子與CD36的結(jié)合界面后,該研究通過對(duì)PROTAC進(jìn)行前藥修飾,使其與CD36的親和力提升10倍,細(xì)胞攝取效率提高3-5倍。
分子膠應(yīng)用范圍大提升
在TPD領(lǐng)域,分子膠以其小分子特性和獨(dú)特的誘導(dǎo)蛋白降解機(jī)制成為另一類重要療法。分子膠是一類能夠誘導(dǎo)或增強(qiáng)兩個(gè)蛋白質(zhì)相互作用的小分子,通常通過促使E3泛素連接酶與目標(biāo)蛋白結(jié)合,觸發(fā)泛素介導(dǎo)的蛋白降解。與PROTAC不同,分子膠本身不是雙功能分子,而是通過改變蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò),間接促成目標(biāo)蛋白的降解。
經(jīng)典的分子膠,如沙利度胺(Thalidomide)及其衍生物可以結(jié)合CRBN(Cereblon)E3泛素連接酶,促使IKZF1/3等轉(zhuǎn)錄因子降解,用于多發(fā)性骨髓瘤治療。CRBN是一種E3泛素連接酶復(fù)合物的底物識(shí)別組分,一項(xiàng)剛剛發(fā)表于《科學(xué)》雜志的研究通過系統(tǒng)探索CRBN的靶點(diǎn)空間,揭示了分子膠誘導(dǎo)的新底物識(shí)別規(guī)則。篩選結(jié)果顯示,共有1633種人類蛋白可能具有表面暴露的G-loop樣基序,能夠與CRBN結(jié)合。這些蛋白覆蓋超過250種結(jié)構(gòu)域和近100種功能類別,其中包含大量傳統(tǒng)上被認(rèn)為"不可成藥"的靶點(diǎn),有望大幅拓展分子膠的應(yīng)用范圍。
![]()
癌癥治療是分子膠研發(fā)的重要方向。今年2月《自然》的兩項(xiàng)背靠背研究發(fā)現(xiàn),某些癌癥突變能使蛋白發(fā)揮類似分子膠的作用。例如髓母細(xì)胞瘤中反復(fù)出現(xiàn)的KBTBD4突變能使KBTBD4蛋白與組蛋白去乙酰化酶1(HDAC1)緊密結(jié)合,進(jìn)而影響表觀遺傳調(diào)控。這種突變誘導(dǎo)的蛋白相互作用與小分子藥物UM171的作用機(jī)制高度相似。UM171作為分子膠,可通過降解HDAC1干預(yù)癌細(xì)胞干性,從而抑制腫瘤生長。研究還發(fā)現(xiàn),UM171分子能夠橋接CUL3-RING E3 KBTBD4的特定結(jié)構(gòu)域和HDAC1的催化結(jié)構(gòu)域,將分子膠的應(yīng)用范圍擴(kuò)展至CRL3 E3家族,拓展了分子膠設(shè)計(jì)的可能性。
多款創(chuàng)新TPD分子涌現(xiàn)
除PROTAC和分子膠外,更多新型TPD技術(shù)正在推動(dòng)該領(lǐng)域向更精準(zhǔn)、更廣泛的方向發(fā)展。例如,溶酶體靶向嵌合體(Lysosome targeting chimera, LYTAC)是一項(xiàng)近年來受到關(guān)注的TPD策略,可以高效將細(xì)胞外蛋白或膜蛋白轉(zhuǎn)運(yùn)到溶酶體中進(jìn)行降解。今年,
Advanced Materials的一項(xiàng)研究介紹了一種新型的LYTAC納米平臺(tái)(NLTC)。NLTC是一種具有功能表面的聚合物納米膠囊,可以在單個(gè)蛋白表面整合蛋白靶向配體、溶酶體靶向配體制備,有效降解特定細(xì)胞外蛋白和膜相關(guān)蛋白。根據(jù)臨床前模型結(jié)果,NLTC能有效降解腫瘤細(xì)胞表面免疫檢查點(diǎn)并緩解腫瘤免疫抑制性微環(huán)境,抑制惡性腫瘤的生長、復(fù)發(fā)和轉(zhuǎn)移。
Nature Chemical Biology的一項(xiàng)研究展示了一種基于自噬機(jī)制的細(xì)胞膜蛋白靶向降解技術(shù)——AUTAB(autophagy-inducing antibody)。該技術(shù)通過將細(xì)胞自噬誘導(dǎo)分子與細(xì)胞膜蛋白靶點(diǎn)抗體進(jìn)行共價(jià)偶聯(lián),可以在不依賴額外細(xì)胞表面蛋白的情況下,精確觸發(fā)靶點(diǎn)蛋白通過自噬-溶酶體路徑降解。實(shí)驗(yàn)中,AUTAB在多種細(xì)胞類型中均可實(shí)現(xiàn)靶蛋白的降解,并且僅需極低濃度就能發(fā)揮作用
今年4月,
Angew雜志還展示了一種膜結(jié)合型胞內(nèi)E3泛素連接酶靶向嵌合體(MembTAC)技術(shù)。與PROTAC需要進(jìn)入胞內(nèi)發(fā)揮作用不同,MembTAC無需細(xì)胞跨膜遞送過程,也能有效利用細(xì)胞內(nèi)E3泛素連接酶實(shí)現(xiàn)對(duì)腫瘤細(xì)胞膜蛋白的降解。這一策略可以進(jìn)一步提升降解效率并減少副作用。這些新類型技術(shù)都展示了TPD領(lǐng)域在腫瘤治療領(lǐng)域的巨大應(yīng)用前景。
![]()
作為賦能全球靶向蛋白降解藥物開發(fā)的重要平臺(tái)之一,藥明康德早在此類藥物的浪潮剛剛興起之際,就快速搭建了綜合性的賦能平臺(tái)。藥明康德一體化平臺(tái)的能力不但涵蓋PROTAC,還包括分子膠、以及多種新興雙功能性蛋白降解劑類型。例如,誘導(dǎo)細(xì)胞外或細(xì)胞膜蛋白進(jìn)入溶酶體進(jìn)行降解的溶酶體靶向嵌合體(LYTAC),將抗體與蛋白降解劑偶聯(lián)產(chǎn)生的蛋白降解劑-抗體偶聯(lián)藥物(DAC),誘導(dǎo)靶蛋白被自噬體吞噬降解的自噬靶向嵌合小分子(AUTAC),以及靶向降解特定RNA的核糖核酸酶靶向嵌合體(RIBOTAC)等。
展望未來,藥明康德將繼續(xù)秉持“讓天下沒有難做的藥,難治的病”的愿景,依托全球研發(fā)基地與生產(chǎn)網(wǎng)絡(luò),以獨(dú)特的一體化、端到端的CRDMO模式,助力靶向蛋白降解劑的開發(fā),幫助合作伙伴將科學(xué)創(chuàng)新轉(zhuǎn)化為惠及全球患者的變革性藥物。
參考資料:
[1] Zhou, J., Tison, K., Zhou, H., et al. (2025). STAT5 and STAT3 balance shapes dendritic cell function and tumour immunity. Nature. https://doi.org/10.1038/s41586-025-09000-3
[2] Wang, Z., Pan, B. S., Manne, R. K., et al. (2025). CD36-mediated endocytosis of proteolysis-targeting chimeras. Cell, 188(12), 3219-3237.e18. https://doi.org/10.1016/j.cell.2025.03.036
[3] Yeo, M. J. R., Zhang, O., Xie, X., et al. (2025). UM171 glues asymmetric CRL3-HDAC1/2 assembly to degrade CoREST corepressors. Nature, 639(8053), 232-240. https://doi.org/10.1038/s41586-024-08532-4
[4] Yang, Y., Jn-Simon, N., He, Y., et al. (2025). A BCL-xL/BCL-2 PROTAC effectively clears senescent cells in the liver. Nature Aging, 5(3), 386-400. https://doi.org/10.1038/s43587-025-00811-7
[5] Xie, X., Zhang, O., Yeo, M. J. R., et al. (2025). Converging mechanism of UM171 and KBTBD4 neomorphic cancer mutations. Nature, 639(8053), 241-249. https://doi.org/10.1038/s41586-024-08533-3
[6] Zhu, S., Gao, H., Jiang, D., et al. (2025). Isoform-specific function of NSD3 in DNA replication stress confers resistance to PARP inhibitors in prostate cancer. Molecular Cell. Advance online publication. https://doi.org/10.1016/j.molcel.2025.06.004
[7] Cheng, B., Li, M., Zheng, J. et al. Chemically engineered antibodies for autophagy-based receptor degradation. Nat Chem Biol 21, 855–866 (2025). https://doi.org/10.1038/s41589-024-01803-1
[8] A Bifunctional Lysosome-Targeting Chimera Nanoplatform for Tumor-Selective Protein Degradation and Enhanced Cancer Immunotherapy. Advanced Materials (2025). DOI: 10.1002/adma.202417942
[9] Membrane-Bounded Intracellular E3 Ubiquitin Ligase-Targeting Chimeras (MembTACs) for Targeted Membrane Protein Degradation. Angew (2025). DOI: 10.1002/anie.202501857
歡迎轉(zhuǎn)發(fā)到朋友圈,謝絕轉(zhuǎn)載到其他平臺(tái)。如有開設(shè)白名單需求,請(qǐng)?jiān)凇皩W(xué)術(shù)經(jīng)緯”公眾號(hào)主頁回復(fù)“轉(zhuǎn)載”獲取轉(zhuǎn)載須知。其他合作需求,請(qǐng)聯(lián)系wuxi_media@wuxiapptec.com。
免責(zé)聲明:本文僅作信息交流之目的,文中觀點(diǎn)不代表藥明康德立場(chǎng),亦不代表藥明康德支持或反對(duì)文中觀點(diǎn)。本文也不是治療方案推薦。如需獲得治療方案指導(dǎo),請(qǐng)前往正規(guī)醫(yī)院就診。
特別聲明:以上內(nèi)容(如有圖片或視頻亦包括在內(nèi))為自媒體平臺(tái)“網(wǎng)易號(hào)”用戶上傳并發(fā)布,本平臺(tái)僅提供信息存儲(chǔ)服務(wù)。
Notice: The content above (including the pictures and videos if any) is uploaded and posted by a user of NetEase Hao, which is a social media platform and only provides information storage services.