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全球每年新發癌癥病例約 1930 萬,病理檢查是癌癥確診的 “金標準”,但全球范圍內病理醫生嚴重短缺,發展中國家和資源匱乏地區的供需矛盾尤為突出。人工智能為自動化病理診斷帶來新可能,卻面臨兩大核心難題:一是訓練需海量標注數據,二是缺乏通用性。即便現有病理基礎模型實現了泛癌癥特征提取,落地應用仍需大量微調訓練和專家資源,難以在資源匱乏地區推廣。在此背景下,開發一款無需訓練、僅靠少量樣本就能實現多癌種識別的通用系統,成為病理 AI 領域的迫切需求。
近日,香港科技大學李小萌教授團隊、廣東省人民醫院張慶玲教授團隊聯合張康教授、哈佛醫學院余坤興教授等 , 在 Nature Cancer 上發表了文章PRET is a few-shot system for pan-cancer recognition without example training,提出全新的 PRET 泛癌種識別系統,為多癌種病理診斷打造了 “即插即用” 的全新解決方案。該系統的核心創新,是將自然語言處理領域的上下文學習概念,首次引入病理圖像分析領域。與傳統 AI 方法不同,PRET 無需任何參數微調,僅在推理階段加入 1–8 張標注切片作為 “視覺上下文”,就能完成學習與識別。其架構包含特征提取器、上下文標注器等六大核心模塊,可一站式支持癌癥篩查、腫瘤分型、腫瘤分割、淋巴結轉移檢測等多種病理診斷任務。
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圖1 : PRET是一個面向多任務的統一框架
1. 大規模跨中心評估
為驗證 PRET 的性能,研究團隊在 23 個國際基準數據集上開展了大規模跨中心評估,數據集涵蓋中、美、荷多國醫院的 4484 張全切片圖像(約 1.24 億個圖像塊),涉及 18 種癌癥類型、9 個器官組織。評估結果顯示,PRET 在 23 個基準任務中的 20 個上表現超越現有方法,15 個基準任務的 AUC 值超 97%,在 CAMELYON16 數據集上性能提升幅度更是達 36.76%;其中結直腸癌篩查 AUC 值達 100%,食管鱗癌腫瘤分割 AUC 值達 99.54%,展現出優異的基礎診斷能力。
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圖2 : PRET 支持多器官、多數據集、多中心和多任務
2. 臨床級淋巴結轉移檢測
針對 臨床級淋巴結轉移檢測這一關鍵任務 , 在 CAMELYON16 數據集上,僅使用 8 張切片樣本,PRET 就實現了臨床級診斷效果。在 0.9875 的相同特異性條件下,其靈敏度較病理醫生常規診斷分別提升 42.86%、36.74%、26.53% 和 16.33%;五次重復實驗中,AUC 值穩定在 0.9834–0.9901 之間,平均值達 0.9871,而 11 位病理醫生 在常規時間限制下 的平均 AUC 值僅為 0.810。更值得關注的是,在數據量減少約 30 倍 時, PRET 的性能 超越了使用 243 張切片訓練的 TransMIL、CLAM 等傳統多樣本方法。
3. 靈活的視覺提示系統
PRET 還設計了靈活的視覺提示系統,支持切片標簽、邊界框、粗略 的 掩碼 和精準的 掩碼四種提示類型,適配不同的標注 成本 。研究發現,不同病理任務適配不同提示類型,甲狀腺乳頭狀癌、食管鱗癌等小腫瘤適合精細提示,結直腸癌、淋巴瘤等大腫瘤僅用切片標簽,就能取得理想診斷效果。
4. 跨種族與欠發達地區的強泛化能力
在泛化能力上,PRET 同樣表現突出。跨種族泛化實驗中,基于 TCGA NSCLC 數據集的 8-shot 設置下,不同種族間的 AUC 最大差異僅 1.32%。針對資源匱乏地區的適用性驗證中,研究團隊選取中國的青海省開展實驗,PRET 在當地甲狀腺乳頭狀癌基準上,僅用 1 個樣本就取得 98.72% 的篩查 AUC 值和 89.85% 的 Dice 分割得分,較現有 基線 方法提升 9.85%。
總結與展望
PRET實現了病理AI領域的范式突破,其核心優勢可概括為五個方面: (1)低數據成本 ,無需大規模標注數據集; (2)單一泛癌模型 ,一個模型覆蓋多種癌癥和任務; (3)無需訓練 ,新任務可直接使用; (4)強泛化性 ,跨種族、跨醫院表現穩健; (5)高靈活性 ,可與多種病理基礎模型無縫集成。
展望未來,研究團隊指出了多個發展方向:進一步優化切片和樣本質量,持續提升診斷性能;將系統應用范圍拓展至突變預測、預后分析等新的病理任務;結合大語言模型的能力,挖掘 PRET 視覺上下文學習的更多潛力,開辟病理診斷 AI 的全新應用場景。
PRET為全球病理AI的普惠化和公平化發展鋪平了道路,尤其有望為醫療資源匱乏地區、少數群體帶來高質量的病理診斷支持,推動癌癥診斷的可及性變革。
該文章的 通訊作者 為: 李 小 萌(香港科技大學)、張 慶 玲(廣東省人民醫院)、張康 ; 共同第一作者 為 : 李 藝 、寧梓妤 。
代碼:https://github.com/xmed-lab/PRET
數據:https://huggingface.co/datasets/yili7eli/PRET
原文鏈接:https://www.nature.com/articles/s43018-026-01141-2
制版人: 十一
學術合作組織
(*排名不分先后)
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戰略合作伙伴
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