摘要:包膜病毒的跨膜糖蛋白是中和抗體的靶點和疫苗核心抗原,傳統(tǒng)研究多依賴可溶性蛋白,難以還原其天然狀態(tài)。本文研發(fā)的病毒糖蛋白納米盤平臺,能將跨膜糖蛋白組裝進(jìn)脂質(zhì)納米碟,實現(xiàn)了SPR親和力檢測、FACS B細(xì)胞分選和冷凍電鏡結(jié)構(gòu)解析的全流程應(yīng)用。以HIV MPER靶向疫苗為核心研究對象,解析了3.5?分辨率的免疫原-抗體復(fù)合物結(jié)構(gòu),還成功應(yīng)用于埃博拉病毒糖蛋白研究,為下一代疫苗的理性設(shè)計提供了高效、通用的工具。一、疫苗研發(fā)的痛點:跨膜抗原研究的傳統(tǒng)困境
研發(fā)包膜病毒疫苗,跨膜糖蛋白是繞不開的核心,這類蛋白也是中和抗體識別的關(guān)鍵靶點。mRNA-LNP技術(shù)能在體內(nèi)表達(dá)天然的跨膜糖蛋白,但體外研究中,科研人員只能通過截斷跨膜域獲得可溶性蛋白,這會丟失膜近端外部區(qū)域(MPER)等關(guān)鍵表位。而MPER正是HIV、流感等病毒疫苗研發(fā)的重要靶點,天然脂質(zhì)環(huán)境的缺失,也讓糖基化修飾、蛋白構(gòu)象的研究與真實情況偏差較大。傳統(tǒng)方法的局限,成了疫苗理性設(shè)計的一大阻礙。
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二、核心突破:標(biāo)準(zhǔn)化的糖蛋白納裝流程
我們搭建了一套可規(guī)模化、高重復(fù)性的納米盤組裝工作流,從細(xì)胞轉(zhuǎn)染到純化出成品僅需5天,1L細(xì)胞能獲得100-700μg純糖蛋白納米盤,足夠完成多次實驗檢測。核心是將細(xì)胞表面的跨膜糖蛋白用去污劑提取后,結(jié)合MSP1D1支架蛋白和脂質(zhì)分子,在親和基質(zhì)上完成“批量組裝”,最終得到的納米碟能在4℃穩(wěn)定保存3個月以上。以HIV Env gp151為基礎(chǔ)構(gòu)建了多款納米盤載體,還為埃博拉病毒糖蛋白適配了相同組裝條件,驗證了平臺的通用性。
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三、SPR多模態(tài)檢測:精準(zhǔn)測量抗體-抗原結(jié)合動力學(xué)
表面等離子體共振(SPR)是疫苗設(shè)計中檢測抗體親和力的核心手段,我們?yōu)榧{米盤平臺開發(fā)了三種SPR檢測模式,適配不同的實驗需求。模式A能測單價Fab的真實親和力,模式B降低了抗體多價效應(yīng)的干擾,模式C則是高通量初篩的高效選擇,能最大程度節(jié)省樣品。用該平臺檢測HIV MPER靶向抗體10E8,發(fā)現(xiàn)工程化后的Env gp151 MPER ND能讓10E8親和力提升70倍,核心原因是解離速率大幅降低;對埃博拉糖蛋白納米盤的檢測也證實,該平臺能精準(zhǔn)區(qū)分抗原特異性抗體的結(jié)合能力。
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四、FACS分選:捕捉疫苗免疫后的特異性B細(xì)胞
疫苗免疫后的B細(xì)胞分選與分析,是研究抗體應(yīng)答的關(guān)鍵,傳統(tǒng)可溶性探針無法識別膜近端表位的特異性B細(xì)胞。我們將生物素化的納米盤作為FACS探針,先在補(bǔ)償珠和工程化Ramos細(xì)胞上驗證了特異性,無明顯背景結(jié)合。在人源化小鼠的HIV疫苗免疫實驗中,成功分選到抗原特異性記憶B細(xì)胞,比例較初始B細(xì)胞提升約4.7倍;在恒河猴模型中,納米盤探針與傳統(tǒng)可溶性蛋白探針的分選效果相當(dāng),還能識別針對跨膜蛋白特有表位的B細(xì)胞,為疫苗免疫應(yīng)答研究提供了新工具。
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五、冷凍電鏡解析:3.5?分辨率解鎖抗體結(jié)合新細(xì)節(jié)
冷凍電鏡(cryo-EM)結(jié)構(gòu)解析是結(jié)構(gòu)導(dǎo)向疫苗設(shè)計的核心,我們利用納米盤平臺解析了Env gp151 MPER ND與3種廣譜中和抗體的復(fù)合物結(jié)構(gòu),最高分辨率達(dá)3.5?。首次發(fā)現(xiàn)10E8的重鏈框架區(qū)3(HFR3)在gp120-gp41界面存在結(jié)合口袋,還觀察到10E8結(jié)合會引發(fā)MPER螺旋的動態(tài)重構(gòu),這些細(xì)節(jié)在傳統(tǒng)肽段-抗體復(fù)合物的晶體結(jié)構(gòu)中完全無法捕捉。通過偽病毒中和實驗驗證,該結(jié)構(gòu)中識別的關(guān)鍵殘基突變,會顯著影響10E8的中和活性,為HIV MPER靶向疫苗的工程化改造提供了精準(zhǔn)的結(jié)構(gòu)模板。
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六、平臺價值:下一代疫苗研發(fā)的通用加速器
這款病毒糖蛋白納米盤平臺的最大優(yōu)勢,是還原了跨膜糖蛋白的天然脂質(zhì)環(huán)境和完整構(gòu)象,讓SPR、FACS、冷凍電鏡這些核心技術(shù)能直接應(yīng)用于天然狀態(tài)的跨膜抗原研究。從HIV到埃博拉的應(yīng)用驗證,證明了其通用性;標(biāo)準(zhǔn)化的組裝流程和穩(wěn)定的產(chǎn)物,也讓其能適配疫苗研發(fā)的迭代設(shè)計需求。除了疫苗研發(fā),該平臺還能拓展到膜蛋白的小分子篩選、抗體發(fā)現(xiàn)等領(lǐng)域,為膜蛋白相關(guān)的生物醫(yī)學(xué)研究提供了全新的技術(shù)支撐。
目前這款平臺已經(jīng)在HIV疫苗的工程化改造中展現(xiàn)出實際價值,后續(xù)針對其他包膜病毒的應(yīng)用還在持續(xù)推進(jìn)。相信隨著技術(shù)的進(jìn)一步優(yōu)化,納米盤會成為跨膜抗原研究的常規(guī)工具,讓疫苗研發(fā)從“經(jīng)驗摸索”向“理性設(shè)計”的轉(zhuǎn)變更高效、更精準(zhǔn)。
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