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圖 1:疫苗平臺與關鍵實驗室技術發展時間線
二、單細胞技術:解析免疫的 “微觀探測器”
單細胞技術涵蓋了表觀基因組學、轉錄組學、蛋白質組學等多個領域,每種技術都能從不同角度揭示細胞的秘密(表 1、圖 2)。
單細胞表觀基因組學里的 scATAC-seq 技術,能檢測染色質的可及性,找出調控免疫反應的關鍵基因區域。比如它能發現病毒感染或疫苗接種后,細胞內哪些基因開關被打開或關閉,從而理解免疫反應的調控機制。
單細胞轉錄組學中的 scRNA-seq 是應用最廣的技術之一,它能分析單個細胞里的 mRNA,識別免疫細胞的亞型,甚至同時檢測宿主和病毒的 RNA,搞清楚病毒到底感染了哪些細胞。而 scVDJ-seq 則專門分析 B 細胞和 T 細胞的受體基因,找到能對抗病毒的關鍵免疫細胞克隆。
單細胞蛋白質組學包括流式細胞術、CyTOF、IMC 等技術,直接檢測細胞里的蛋白質。比如流式細胞術能快速分析大量細胞的蛋白表達,IMC 還能在組織切片里定位蛋白,看清免疫細胞在組織里的分布和相互作用。
此外,CITE-seq這類多組學技術,還能同時分析細胞的轉錄組和蛋白質組,讓科學家對細胞狀態的理解更全面。
表 1:感染和疫苗研究中的常見單細胞技術,包含技術類型、研究視角、應用案例、通量和多重性、相關綜述等內容
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圖 2:用于疫苗研發的單細胞技術選擇與應用,展示了表觀基因組學、轉錄組學、蛋白質組學等技術在病毒感染或疫苗接種研究中的應用
三、單細胞技術如何重塑疫苗研發全流程
單細胞技術正在改變研究人員對病毒感染免疫反應的研究方式,為解析細胞異質性提供了前所未有的分辨率。這些技術如今正越來越多地應用于疫苗研發的整個流程,從揭示免疫激活機制到評估疫苗效力,再到優化生產工藝(圖 3)。下面,我們將通過代表性研究,展示單細胞技術如何塑造疫苗學領域,加速疫苗的發現與應用。具體來說,我們將介紹單細胞技術如何助力疫苗的研發、評估與生產。
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圖 3:疫苗研發階段。綠色箭頭表示標準的順序推進流程,紅色箭頭表示因研發失敗回到早期階段,橙色箭頭表示信息反饋對前期階段的優化。
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2023年疫苗接種攻略
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撰寫| 生物制品圈
校稿| Gddra編審| Hide / Blue sea
編輯 設計| Alice
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