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基于阻斷置換擴增技術提高傳統Sanger測序靈敏性在檢測與輔助診斷華氏巨球蛋白血癥中的應用
第一完成人:病理科 顧怡瑾
第二完成人:病理科 王朝夫 董磊
第三完成人:病理科 李醫民
2024年冬,一位63歲的男性患者因不明原因的雙下肢持續水腫,在外院未能獲得明確診斷。瑞金醫院血液科初步檢查發現其血清中IgM異常升高,超聲提示全身多處淋巴結腫大,臨床高度懷疑為血液系統腫瘤。在進一步的病理評估中,穿刺組織先經基因檢測確認存在MYD88基因L265P突變,進一步采用阻斷置換擴增改良的Sanger測序(BDA Sanger)檢測,檢出CXCR4基因S338X低頻熱點突變。后來經數字PCR法(dPCR)驗證,該突變頻率僅為0.46%。最終,借助MYD88基因與CXCR4基因的BDA Sanger檢測結果,輔助明確了華氏巨球蛋白血癥(Waldenstr?m macroglobulinemia)的病理診斷,并且為臨床治療提供了關鍵依據。
華氏巨球蛋白血癥屬罕見病,其年發病率約為每百萬人中3-4人。許多患者在早期可能沒有任何癥狀, 只是在體檢時發現血象異常或血球蛋白增高,進一步患者會出現乏力、出血、視力模糊及手腳麻木等癥狀,均源于癌細胞在骨髓中的增殖和大量名為“IgM”的異常免疫球蛋白在血液中作祟。人體內的免疫球蛋白有多種,IgM的個頭最大,所以才有巨球蛋白的名稱。WM的診斷需要結合血常規、血免疫固定電泳、骨髓穿刺活檢以及基因檢測等多項檢查來綜合判斷,而MYD88和CXCR4基因就是WM診療過程中高度依賴的分子標志物。其中,MYD88基因L265P突變幾乎見于95%以上的WM病例,而CXCR4基因突變則更為復雜——不僅存在多個熱點(如S338X、R334X),且突變頻率常低于10%,極易被常規方法漏檢。傳統Sanger測序法雖成本低廉、操作簡便,但靈敏度通常僅限于15%–20%的變異等位基因頻率(VAF),如同在昏暗燈光下辨認細小字跡,稍有不慎便會遺漏關鍵信息。
數字PCR法或二代測序法雖靈敏度高,但要么受限于檢測試劑不普及,要么因為費用高與檢測流程復雜,難以廣泛普及。面對這一臨床痛點,瑞金醫院病理科聯合分子診斷團隊,自主設計研發了針對CXCR4基因的阻斷置換擴增(Blocker Displacement Amplification, BDA)技術,利用特異性阻斷劑“屏蔽”野生型DNA序列擴增,使突變序列在PCR過程中獲得優先放大,從而將檢測靈敏度提升至0.2% ——相當于在一萬個正常細胞中精準識別出二十個攜帶突變的“異類”。
此例患者的傳統Sanger測序CXCR4基因的檢測結果呈陰性,未能解釋患者對BTK抑制劑治療反應不佳的潛在原因。因此,瑞金醫院病理科針對這一致病基因探索性的使用了這項創新技術:BDA Sanger檢測。通過該方法,團隊成功檢出該患者的CXCR4 S338X位點是一個低頻突變,經數字PCR法驗證,低頻突變的頻率僅為0.46%。這一發現不僅補全了分子診斷拼圖,更直接指導了后續個體化治療策略的制定,成為精準病理診斷的一次生動實踐。
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這項技術不僅實現了對CXCR4基因多位點突變的同步檢測,還能覆蓋插入、缺失等復雜變異類型。在方法學驗證中,其準確率達100%,對S338X和R334X的最低檢出限分別為0.2%和0.4%。與傳統Sanger平行對比,此項新技術陽性檢出率提升15.7%,顯著減少了假陰性風險。已有相當數量的標本利用該技術完成檢測,大幅提升了WM及其他相關淋巴瘤的分子分型精度,同時將單樣本檢測成本控制在合理區間,真正讓精準診斷“飛入尋常醫院”。相關核心技術已申請國家發明專利,并在2025年美國分子病理學會年會上引發國際同行關注,彰顯中國病理人在前沿診斷技術上的創新能力。
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值得一提的是,這一分子病理層面的突破,正與瑞金醫院在人工智能時代的整體戰略布局深度協同。2025年,瑞金醫院正式開源了臨床級多模態病理大模型RuiPath,覆蓋包括淋巴瘤在內的19種常見癌種,構建起從宏觀組織形態到微觀基因變異的全鏈條智能輔助診斷體系。如果說BDA-Sanger技術是在“顯微鏡下捕捉基因的低語”,那么RuiPath則是在“數字森林中自動標記每一棵異常之樹”。醫生如今可在RuiPath系統中一鍵調取AI預判的病灶區域、組織學分級、脈管侵犯等數十項結構化指標,再結合高敏分子檢測結果,實現“形態+分子+臨床”的三維整合診斷。這種“AI Copilot + 精準分子工具”的雙輪驅動模式,正在重塑現代病理科的工作范式。
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作為國家病理質控中心的重要成員單位,瑞金醫院病理科始終以解決臨床真實問題為導向,既深耕分子診斷的技術細節,也擁抱AI賦能的系統變革。從一個低頻CXCR4突變的精準捕獲,到百萬級數字切片訓練出的通用病理大模型,瑞金正以扎實的科研轉化能力,推動中國病理診斷從“經驗主導”邁向“數據與智能驅動”的新紀元。未來,隨著RuiPath多中心計劃的推進和更多如BDA-Sanger這樣的創新技術落地,優質病理資源將不再局限于頂尖三甲,而是通過標準化、智能化的路徑,惠及更廣泛的患者群體——這正是瑞金醫者“廣博慈愛,追求卓越”精神在數字時代的全新詮釋。
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供 稿丨病理科
編 輯丨溫兆琦
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