大藥企賣疫苗等生物制品不再按3%簡易計稅

2026年之前大中型藥品經營企業賣疫苗等生物制品，可以選擇簡易辦法按照生物制品銷售額和3%的征收率計算繳納增值稅，而這一優惠政策從今年起將取消。

近期，財政部、稅務總局公布《關于增值稅法施行后增值稅優惠政策銜接事項的公告》（下稱《公告》），其中明確了今年起仍適用簡易計稅方法的項目，但并沒有提及生物制品簡易計稅政策。

《公告》稱，除本公告和增值稅法、增值稅法實施條例、《財政部 稅務總局關于個人銷售住房增值稅政策的公告》外，在2025年12月31日前制發文件規定的國內環節增值稅優惠政策同時停止執行。

資深稅務專家李軍告訴第一財經，這意味著今年生物制品不再適用簡易計稅政策。

安永研報解讀稱，這意味著自2026年1月1日起，上述一般納稅人銷售以上自產生物制品或經營生物制品，不再適用3%的簡易征收率，而應當根據具體生物制品種類確定適用稅率，按一般計稅方法計算繳納增值稅并可按規定抵扣進項稅額。

所謂生物制品，一般是指應用基因工程、細胞工程、蛋白質工程及發酵工程等生物技術制備的微生物、細胞、組織或液體成分，用于人類疾病預防、治療和診斷的藥品，具體包括疫苗、血液制品、抗體藥物等類型。

此前財政部、稅務總局發布多項政策，對增值稅一般納稅人銷售自產的生物制品、屬于增值稅一般納稅人的藥品經營企業銷售生物制品或獸用生物制品，均可以選擇簡易辦法按照生物制品銷售額和3%征收率來計算繳納增值稅。

當然，上述增值稅一般納稅人也可以采取一般計稅方法，應繳納增值稅稅額為銷項稅額減去進項稅額，其中銷項稅額為生物制品的銷售額乘以稅率，該稅率主要為13%。

上海國家會計學院副教授葛玉御告訴第一財經，由于之前生產銷售生物制品企業缺少進項稅額或進項稅額較少，所以采用簡易計稅方式可以減輕企業稅負。

李軍表示，當初給生物制品簡易計稅政策主要是因為疫苗等生物制品關系著百姓健康，在發展初期應給予鼓勵。隨著近年來我國生物制藥行業的蓬勃發展，簡易計稅的鼓勵效應有所下降。另外生物制品的下游也有很多是適用一般計稅方式的制藥企業，上游生物制品采用簡易計稅反而造成了重復征稅或者沒有達到減稅的效果。因此，此次增值稅法出臺取消了生物制品的簡易計稅。

多位專家告訴第一財經，此前部分企業濫用上述生物制品簡易計稅政策，稅務部門近年強化了征管。

此次生物制品簡易計稅優惠政策取消，對相關企業有何影響？

葛玉御認為，一些頭部企業產業鏈條完善、進項抵扣充分，采取一般計稅下稅務可能會降低或稅負保持平衡。但對其他進項稅額不足的部分生物制藥企業來說，稅負有可能會上升。

李軍表示，此次《公告》生物制品的簡易計稅政策，相關企業稅負的變化取決于企業的具體情況以及在產業鏈條中的地位。對于企業來講，應該迅速梳理供應商和客戶的情況，通過價格機制的調整以適應本次稅收政策變化。

安永研報認為，對于以往選擇簡易計稅的生物制品企業而言，盡管可以抵扣進項稅額，但由于生物制品行業的特殊性（如研發投入大、部分原材料難以取得進項發票等），實際稅負可能仍將上升。

安永建議，生物制品生產和經營企業應當立即開展稅負影響測算，梳理進項稅額抵扣鏈條，優化供應商選擇和采購管理，確保能夠取得合規的增值稅專用發票。同時，建議在產品定價、合同簽訂時充分考慮稅負變化因素，并與下游客戶做好溝通協調。

葛玉御表示，根據《公告》，在生物制品中，像抗癌藥、罕見病藥仍保留了簡易計稅3%優惠政策。

《公告》明確了2026年1月1日至2027年12月31日仍然有效的簡易計稅增值稅優惠政策，其中包括四項政策，分別是《財政部 海關總署 稅務總局 國家藥品監督管理局關于抗癌藥品增值稅政策的通知》；《財政部 海關總署 稅務總局 藥監局關于罕見病藥品增值稅政策的通知》；《財政部 海關總署 稅務總局 藥監局關于發布第二批適用增值稅政策的抗癌藥品和罕見病藥品清單的公告》；《財政部 海關總署 稅務總局 藥監局關于發布第三批適用增值稅政策的抗癌藥品和罕見病藥品清單的公告》。

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撰寫| 第一財經

校稿| Gddra編審| Hide / Blue sea

編輯 設計| Alice