當(dāng)你滿懷期待地開展空間轉(zhuǎn)錄組實(shí)驗(yàn),是否也曾遇到這些困擾:
想捕捉腫瘤微環(huán)境中的細(xì)胞互動,卻因分辨率不足而錯過關(guān)鍵的低豐度細(xì)胞
手握珍貴樣本,卻因技術(shù)不匹配,眼睜睜看著它們變成「數(shù)據(jù)孤島」
實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)早已規(guī)劃,卻因設(shè)備昂貴、流程復(fù)雜而遲遲難以落地
而以 Slide-seq 和 Slide-tags 為代表的 Nature、Science 級別技術(shù),正推動空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)向前邁進(jìn)以應(yīng)對這些挑戰(zhàn) ——無需專用空間組學(xué)設(shè)備,即可實(shí)現(xiàn)近乎單細(xì)胞級別的高分辨率,并具備廣泛的真核生物物種兼容性。
Slide-seq、Slide-tags 技術(shù)原理
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那么,在現(xiàn)實(shí)的科研場景中,我們該如何突破技術(shù)壁壘,高效開啟高質(zhì)量的空間生物學(xué)研究?寶日醫(yī)將于2025 年 11 月 20 日(周四)14:00,推出專題講座《從技術(shù)原理到數(shù)據(jù)分析,全面拆解單細(xì)胞空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)》。本次直播將直面當(dāng)前空間轉(zhuǎn)錄組研究中的典型痛點(diǎn),分享無需專用設(shè)備即可實(shí)現(xiàn)高分辨率的靈活解決方案—— 基于 Slide-seq 與 Slide-tags 兩大前沿技術(shù)衍生的 Seeker 與 Trekker 深度解析。現(xiàn)在報(bào)名直播,還有機(jī)會贏取樂扣保溫杯、熊貓抱枕被、計(jì)時器、洗漱化妝包、數(shù)據(jù)線、帆布包等多重精美禮品!
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直播亮點(diǎn)搶先看:
空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)前沿與 Takara 雙技術(shù)路線解析
從瓶頸到破局:空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)怎么選?分辨率與適用場景深度解析
方案核心揭秘:深度剖析 Takara Seeker 與 Trekker 雙技術(shù)路線的原理、獨(dú)特優(yōu)勢與適用場景。
案例解讀:單細(xì)胞分辨率空間組學(xué)方案的應(yīng)用實(shí)戰(zhàn)與案例分享
小貼士:Seeker 與 Trekker 技術(shù)路線
Seeker Spatial Transcriptomics Kit
無需 NGS 以外的專用設(shè)備和探針,也無需具備顯微操作專業(yè)知識
以含有 polyA 的全轉(zhuǎn)錄組為對象進(jìn)行 NGS 分析,支持人、鼠以外的真核生物
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Trekker Single-Cell Spatial Mapping Kit
真正單細(xì)胞分辨率:無需解卷積、無需分割,更無需復(fù)雜算法
通過 DNA 條形碼標(biāo)記細(xì)胞核,無需分割即可進(jìn)行準(zhǔn)確的空間分析
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內(nèi)容策劃:沈佳鈺
內(nèi)容審核:朱卿
題圖來源:圖蟲創(chuàng)意
參考文獻(xiàn)
[1].Rodriques SG, Stickels RR, Goeva A, et al. Slide-seq: A scalable technology for measuring genome-wide expression at high spatial resolution. Science. 2019 Mar 29;363(6434):1463-1467. doi: 10.1126/science.aaw1219.
[2].Stickels RR, Murray E, Kumar P, et al. Highly sensitive spatial transcriptomics at near-cellular resolution with Slide-seqV2. Nat Biotechnol. 2021;39(3):313-319. doi:10.1038/s41587-020-0739-1
[3].You Y, Fu Y, Li L, et al. Systematic comparison of sequencing-based spatial transcriptomic methods. Nat Methods. 2024;21(9):1743-1754. doi:10.1038/s41592-024-02325-3
[4].Russell AJC, Weir JA, Nadaf NM, et al. Slide-tags enables single-nucleus barcoding for multimodal spatial genomics. Nature. 2024 Jan;625(7993):101-109. doi: 10.1038/s41586-023-06837-4.
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