廣東
近日，南京農業大學資源與環境科學學院沈其榮院士團隊張瑞福教授課題組在《Nature Communications》期刊上發表題為“General variation in the Fusarium wilt rhizosphere microbiome”的研究成果。南京農業大學資源與環境科學學院博士研究生蘇律（現任中國農業科學院生物技術研究所副研究員）與博士后馮海超（現任河南大學農學院研究員）為共同第一作者，南京農業大學張瑞福教授與中國農業科學院生物技術研究所燕永亮研究員為共同通訊作者，沈其榮院士對本研究提供了重要指導。
本領域以往研究多集中于單一作物或局部土壤環境，缺乏跨系統的整合分析，限制了普適性規律的發現。該研究通過Meta分析整合了來自多個獨立研究的根際微生物組數據，并結合代謝組、宏基因組、轉錄組，系統揭示了鐮刀菌侵染下根際微生物組的功能與結構變化規律。此外，研究團隊創新性地提出了“操作性分析單元”概念，將來自不同地點、不同寄主植物根際樣本，在盡可能相同的條件下進行分組比較，以剝離環境噪音，捕捉真實的病害信號。研究發現鐮刀菌侵染可穩定地改變根際細菌群落結構。其中，黃桿菌屬在發病植株根際顯著富集，并可抑制病原菌生長。進一步研究通過代謝組鑒定到發病植株根系分泌物中的生育酚顯著富集，該物質能促進根際黃桿菌生長。黃桿菌與生育酚聯合使用可顯著降低番茄枯萎病的發病指數，并有效提升根際黃桿菌豐度。
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