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圖源:Unsplash
撰文|王曉東
又是一年過去了。北生所(NIBS)大廳里的圣誕樹再次亮起,紅綠閃爍的燈光提醒我:這是我全職回到北生所的第十五個年頭。今年的燈似乎比往年更亮一些,也許是眼睛開始老花的效果?不過,今年確實(shí)北生所的豐收年。
年初,徐墨和邵峰實(shí)驗(yàn)室合作揭示多種過敏原通過在肥大細(xì)胞上“打孔”激活I(lǐng)I型免疫反應(yīng);年中,陳婷實(shí)驗(yàn)室發(fā)現(xiàn)毛發(fā)干細(xì)胞竟然是由基底成纖維細(xì)胞的鉀離子電信號所激活;再到張二荃實(shí)驗(yàn)室提出統(tǒng)一真核與原核生物生物節(jié)律的時間標(biāo)尺,居然來源于極慢速的每日十五個ATP水解過程;年底,邵峰實(shí)驗(yàn)室又發(fā)現(xiàn)了腫瘤免疫的新機(jī)制。
與此同時,黃牛實(shí)驗(yàn)室在國際會議上發(fā)布了可移植的虛擬篩選框架 SWDOCKP2,實(shí)現(xiàn)了每日1.9萬億個蛋白質(zhì)–配體分子對接的理論計(jì)算速度,把基于結(jié)構(gòu)的虛擬篩選能力推向了接近整個人類蛋白質(zhì)組覆蓋的尺度。
這些成果看似集中爆發(fā),實(shí)則都是多年積累終于水到渠成。科研雖然需要靈光一閃,更多靠的是耐心、重復(fù)、以及把“今天不行”忍到“明天再試一次”。我曾開玩笑地對徐墨說,你這是“六年‘墨’一篇”。在五年評估的壓力之下,他居然有勇氣用六年時間才發(fā)第一篇文章,也不怕科研弟子江湖老,脫發(fā)沒有“帽子”罩。
當(dāng)然,年底依舊不出意外,我本人的實(shí)驗(yàn)室則連續(xù)第十三年與CNS 擦肩而過。
好在我們實(shí)驗(yàn)室的年度賀年MV如期殺青。大概看我們MV的同學(xué),比看我們科研文章的多得多。雖然不能對標(biāo)網(wǎng)紅科學(xué)家,也算是以我們的方式刷一刷存在感。
01 十字路口的北生所
十五年前的初秋,我拉著行李箱全職回國來到北生所紅樓前。燈還是這些燈,樹還是那棵樹。樓外2003年剛成立時種下的那棵銀杏,不過小腿粗細(xì)。秋天一到,依然稚嫩的枝杈卻也不吝嗇,抖落出一地金黃。那時離北生所成立剛好七年。七年,對樹不算長;對人,卻足以讓初見之人顯出些許疲態(tài),舊得不動聲色。這七年間,北生所的科研大樓已滿滿當(dāng)當(dāng),二十來個實(shí)驗(yàn)室分布在四層。不少是在做擬南芥、秀麗線蟲這些“老朋友”。七年前那句“給我1%的生命科學(xué)基礎(chǔ)研究經(jīng)費(fèi),還你50%的重大原創(chuàng)成果”,那句豪言壯語,還真變成了統(tǒng)計(jì)學(xué)事實(shí):2012年中國CNS文章二十篇里,有十篇出自這里。
光芒之下,危機(jī)卻也悄然顯形。
自2003年起,北生所每年1.3億的穩(wěn)定支持模式,在成立的七年以后,第一次開始顯得吃力。實(shí)驗(yàn)室數(shù)目在長,人員在相應(yīng)增多,通貨膨脹從不講情懷。錢,不夠了。科技部和北京科委以外新的來源一時半會兒看不見。共同所長和學(xué)術(shù)副所長去了北大。北京十月的秋風(fēng)里,只剩下我一個人站在原地凌亂。
擺在面前的選擇并不復(fù)雜:要么放棄,老老實(shí)實(shí)回去當(dāng)我的HHMI研究員;要么全職回來,硬扛。或者說得直白一點(diǎn):不能同日同月生(入職),可以同日同月死。
不是在危機(jī)中滅亡,就是在危機(jī)中崛起。我最先想到的,是不是推動成立一個國家級新興技術(shù)研究院,干脆把NIBS并進(jìn)去,作為生物技術(shù)研究的基石?這個設(shè)想出現(xiàn)得很快,被否定得也同樣干脆。
迷茫之中,收到了很多來自各界朋友的關(guān)切。《鳳凰周刊》做了一篇深度報(bào)道《十字路口的北生所》,并且第一時間送到了領(lǐng)導(dǎo)案頭。回應(yīng)隨之而來,卻多少有些出人意料:一位多年未曾聯(lián)系的老友托人帶話,要不要去南方某個城市“落腳”;另一位企業(yè)界朋友更直接:NIBS能不能整體成為他們的研發(fā)機(jī)構(gòu),由企業(yè)來養(yǎng)。
那一刻,像是被人輕輕敲了一下后腦勺。與其求人,不如自救。
NIBS這些年持續(xù)不斷地在生命機(jī)制上做出原創(chuàng)發(fā)現(xiàn),為什么不能產(chǎn)業(yè)化?為什么一定要停留在“論文—經(jīng)費(fèi)—論文”的單循環(huán)里?這樣一來,反而能解決一個從創(chuàng)始之初就懸在頭頂?shù)脑憜枺鹤鳛榈胤秸本┦袨槭裁匆L期支持一個以基礎(chǔ)科研為主的研究所?如果科研成果能夠就地轉(zhuǎn)化,服務(wù)地方經(jīng)濟(jì),這個問題至少在邏輯上說得過去。
更重要的是,既然北生所被定位為“科技體制改革試驗(yàn)田”,那它若要繼續(xù)存在下去,就不能只在“做基礎(chǔ)研究”上證明自己,而是要不斷的地通過制度創(chuàng)新給科技發(fā)展的痛點(diǎn)提供參考答案。而科技界的那個被反復(fù)提起、卻始終無解的老問題:產(chǎn)學(xué)研脫節(jié),北生所是否能給出一個真正可執(zhí)行的答案。
生存還是毀滅,不再是臺詞,而是當(dāng)時北生所面臨的現(xiàn)實(shí)問題。
是并入體制、吃皇糧,讓“試驗(yàn)田”體面收官;還是繼續(xù)咬牙堅(jiān)持,除了給青年科學(xué)家一個真正心無旁騖的環(huán)境,繼續(xù)做能影響世界的原創(chuàng)工作,同時開辟新的賽道,打通科技成果轉(zhuǎn)化之路,進(jìn)軍經(jīng)濟(jì)主戰(zhàn)場?
我去找了HHMI的領(lǐng)導(dǎo),提了一個設(shè)想:把原來支持我個人實(shí)驗(yàn)室的經(jīng)費(fèi),改成一個HHMI國際青年科學(xué)家支持項(xiàng)目:全球申請(美國除外),集中評估,擇優(yōu)支持,每人每年10萬美金。這個提議居然得到了回應(yīng)。第一年支持了20位青年科學(xué)家,其中NIBS占了四位。
那一刻,說不驕傲,不感動是假的。
但這點(diǎn)錢終究只是杯水車薪。它不僅沒能踩住危機(jī)的剎車,帶動新的經(jīng)費(fèi)支持,反而產(chǎn)生了一個意想不到的后果:拿到HHMI支持的四位青年研究員,三位很快被體制內(nèi)單位挖走。
像是閘門被撬開一個縫。水,開始外涌。短時間內(nèi),十一位NIBS實(shí)驗(yàn)室主任相繼跳槽。加上之前其他原因離職的七位,NIBS的實(shí)驗(yàn)樓,突然間空蕩了起來。風(fēng)還在吹,銀杏葉還在落。而我第一次意識到:很多初衷很好,看上去不錯的辦法,反而會加重問題本身。北生所真正要做的,不是補(bǔ)一個洞,而是重新設(shè)計(jì)一張網(wǎng),把長期橫亙在產(chǎn)學(xué)研之間的那些堵點(diǎn),想辦法真正打通。
02 臨淵羨魚,不如退而結(jié)網(wǎng)
理想很豐滿,現(xiàn)實(shí)卻異常骨感。要把原始創(chuàng)新實(shí)驗(yàn)室里的科研成果,真正轉(zhuǎn)化成社會需要的產(chǎn)品,至少還缺幾個要素。而首要的,是有真正面向社會需要的科研成果。有一個學(xué)術(shù)界很少公開討論、卻人人心知肚明的事實(shí):學(xué)術(shù)研究,更多是在解決學(xué)術(shù)體系內(nèi)部產(chǎn)生的問題:一個實(shí)驗(yàn)室發(fā)現(xiàn)現(xiàn)象暫時無法被現(xiàn)有理論解釋,一個推論需要被驗(yàn)證,或者某項(xiàng)技術(shù)發(fā)展到了可以“往前再推一步”的節(jié)點(diǎn)。成果的最終形態(tài),是論文。論文的發(fā)表、傳播與評價,幾乎完全發(fā)生在小同行的圈子里。論文,就是終極成果。
學(xué)術(shù)的底層邏輯,是求新。甚至未必是求全對,更談不上求用。它更像一條河:追求的是流動,是水量,是不斷向前。只要在流,體系就能自凈:錯誤會慢慢沉到河底,新的知識和技術(shù)會被水流帶向人類認(rèn)知未到的疆域。
工業(yè)界則站在河岸上捕魚:從論文中尋找可能“有用”的點(diǎn),驗(yàn)證、篩選、放大,再開發(fā)。在這個過程中,無用就是有用。對象不同,各取所需。問題在于,如果學(xué)術(shù)界自己要下水做轉(zhuǎn)化,就必須從一開始去做社會真正需要解決的問題。而這些問題往往高度復(fù)雜、跨學(xué)科、長周期,牽涉工程、法規(guī)、成本、倫理與市場,早已超出了傳統(tǒng)學(xué)術(shù)訓(xùn)練和評價體系所能獨(dú)立承載的能力范圍。這不是態(tài)度問題,而是結(jié)構(gòu)性不匹配。
所以北生所首先要做的,不是臨淵羨魚,而是退而結(jié)網(wǎng)。結(jié)網(wǎng),意味著建立真正能承接“轉(zhuǎn)化”的能力:比如,一個可以做人源化、工程化的抗體中心,把實(shí)驗(yàn)室里那些被證明能夠調(diào)節(jié)生命活動的靶點(diǎn),直接做成抗體藥;再比如,建立化學(xué)篩選和藥物化學(xué)中心,做出能夠在動物模型中驗(yàn)證功能的工具化合物。這樣做并沒有背離基礎(chǔ)研究的初衷,只是讓發(fā)現(xiàn)多了一條去向。同時,也第一次讓這些成果擁有了可以被社會估價的形態(tài):藥物前體。
問題在于,新藥研發(fā)是一條漫長、昂貴、而且我們并不熟悉的道路。站在2010年,放眼全國,我們能拿得出、被全世界認(rèn)可的原創(chuàng)新藥,只有兩個:一個是治療瘧疾的青蒿素,一個是治療急性早幼粒白血病的砒霜。坦率地說,都還是老祖宗留下的。
03 突破:乙型肝炎受體的故事
現(xiàn)實(shí)像北京冬季的風(fēng),冷得讓人清醒。但值得慶幸的是,轉(zhuǎn)機(jī)并沒有讓人等得太久。
2012年,北生所迎來了第一個真正意義上的可轉(zhuǎn)化成果:李文輝實(shí)驗(yàn)室發(fā)現(xiàn)了乙型肝炎病毒的受體:牛磺膽酸鈉共轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白, NTCP。
發(fā)現(xiàn)乙型肝炎受體的故事,值得大書特書。因?yàn)檫@個問題,在乙肝研究領(lǐng)域里困住了一代又一代研究人員,前后幾十年。不是他們無能,實(shí)在是敵人太狡猾。首先,沒有一個簡單可用的體外細(xì)胞培養(yǎng)體系;更致命的是,也沒有合適的動物模型。常用實(shí)驗(yàn)動物,幾乎無一例外不能感染人類乙肝病毒。研究從一開始,就站在了“沒有抓手”的地方。
文輝在來北生所建立獨(dú)立實(shí)驗(yàn)室之前,并沒有研究過乙肝。現(xiàn)在卻要直面一個幾十年未解的難題。哪怕他此前有發(fā)現(xiàn)SARS病毒受體的成功經(jīng)驗(yàn),這兩件事的難度也根本不在一個量級。這不是聰明能解決的問題,而是需要一種千里之行始于足下的決心、耐心,以及不被嘲笑動搖的勇氣。
他從最基礎(chǔ)的文獻(xiàn)閱讀開始,在故紙堆里翻出一條幾乎被遺忘的線索:中國科學(xué)家曾報(bào)道過,一種東南亞特有的靈長類動物——樹鼩——可以被人類乙肝病毒感染。樹鼩,松鼠大小,聽起來不像一個“正經(jīng)”的實(shí)驗(yàn)動物。那就從零開始:從在NIBS建樹鼩房、養(yǎng)樹鼩開始。
樹鼩不是標(biāo)準(zhǔn)實(shí)驗(yàn)動物,沒有現(xiàn)成的基因組資源,沒有成熟的實(shí)驗(yàn)工具體系。他便和NIBS的生物信息中心合作,從頭建立基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫;和北大陳鵬實(shí)驗(yàn)室合作,合成含有非天然、可光交聯(lián)氨基酸的靶標(biāo);和NIBS抗體中心合作,制備特異性的檢測抗體;再和蛋白質(zhì)中心協(xié)作,一步步追蹤,最終鎖定NTCP。
真正被鑒定出來的,是一個樹鼩特有、非疏水的肽段。否則,如果像其他動物(包括人類)那樣,NTCP是一個三十多千道爾頓、十次跨膜的蛋白,在技術(shù)上幾乎不可能被直接抓到。回頭看,這條路徑上的每一步單獨(dú)拿出來都是小概率事件;疊加在一起,幾乎就是一個“不該發(fā)生”的故事。但它發(fā)生了,發(fā)生在昌平的北生所,一個如假包換的城鄉(xiāng)結(jié)合部。
古人說,天道酬勤。這句話聽起來老套,可在這個故事里,卻是樸素而粗糲的真理。科學(xué)不相信眼淚;不僅不信,它連玩笑都不接。整整六年,幾乎是貼著懸崖在走。文輝后來跟我說,在實(shí)驗(yàn)最關(guān)鍵的那段時間,他手臂會不受控制地緊張、抖動。不是疲勞,是長期壓抑后的生理反應(yīng)。
文章發(fā)表的過程也不順利。李文輝關(guān)于乙肝受體的工作,連續(xù)投了三個雜志,全被鋸掉。領(lǐng)域里的人不信,雜志編輯也不信。原因其實(shí)并不復(fù)雜:第一,乙肝病毒受體這件事在這個領(lǐng)域里早就有太多“狼來了”的故事,一次次看似接近真相,最后卻被證偽,消耗的不只是耐心,還有整個領(lǐng)域的信任閾值。第二,幾十年里,業(yè)界和學(xué)界的大佬們前赴后繼毫無結(jié)果。現(xiàn)在,卻是一個此前并不研究乙肝、單位也并不“顯赫”的中國實(shí)驗(yàn)室聲稱把問題解決了。在心理上確實(shí)難以接受。說到底,這不是對數(shù)據(jù)的懷疑,而是對“誰有資格做出這個發(fā)現(xiàn)”的懷疑。
后來文章投向一個新雜志。沒有歷史包袱,也沒有“這事不該由你們完成”的預(yù)設(shè)立場。當(dāng)文章最終發(fā)表出來的那一天,并沒有想象中的歡呼。更多的是一種“終于可以把肩上的石頭放下來”的沉默。科學(xué)體系本身是保守的,突破往往來自邊緣,而代價通常由最孤獨(dú)的人先付。
科學(xué)依舊不相信眼淚。但至少,在去年文輝被國際乙肝研究大會授予特殊成就獎,并被全體參會者自發(fā)起立鼓掌那一刻,現(xiàn)實(shí)還是承認(rèn)了一次長期堅(jiān)持的正當(dāng)性。
更現(xiàn)實(shí)的一面是:NTCP的發(fā)現(xiàn),使乙肝病毒在細(xì)胞系中實(shí)現(xiàn)感染和復(fù)制成為現(xiàn)實(shí),也使得針對病毒入侵環(huán)節(jié)的系統(tǒng)性藥物篩選成為可能。這個進(jìn)展在當(dāng)時解決的是一個長期缺乏實(shí)驗(yàn)體系支撐的基礎(chǔ)問題,但它對轉(zhuǎn)化研究的意義很快顯現(xiàn)。
在北京市科委基金的支持下,面向乙肝和丁肝治療的華輝安健得以成立。隨后,一批以北生所原創(chuàng)成果為源頭的企業(yè)陸續(xù)創(chuàng)辦,包括邵峰創(chuàng)建的炎明生物、湯楠創(chuàng)建的普沐生物、羅敏敏的健達(dá)九州,以及張志遠(yuǎn)和我創(chuàng)辦的維泰瑞龍相繼落戶中關(guān)村生命科學(xué)園。到2022年,這些企業(yè)在市場上完成的融資總額,已超過北京市對北生所的累計(jì)直接資助規(guī)模,在客觀上形成了地方政府支持基礎(chǔ)研究、科技創(chuàng)新反哺區(qū)域經(jīng)濟(jì)的閉環(huán)。隨著這些公司的多個項(xiàng)目進(jìn)入臨床試驗(yàn)階段并接受臨床驗(yàn)證,源自北生所的原創(chuàng)成果轉(zhuǎn)化為面向全球未滿足醫(yī)療需求的首創(chuàng)藥物,開始從可能性走向現(xiàn)實(shí)路徑。
04 AI 會不會改變生命科學(xué)研究的基本范式?
最近在多個場合被追問另一個更“當(dāng)下”的問題:進(jìn)入2025,AI會不會改變生命科學(xué)研究的基本范式?我開玩笑說,現(xiàn)在會拼A和I的人都說自己在做 AI。但玩笑歸玩笑,我并不否認(rèn):以深度學(xué)習(xí)和大模型為基礎(chǔ)的工具,確實(shí)給苦秦久矣的生命科學(xué)界帶來希望。這里的“秦”,指的是研究對象本身就是復(fù)雜系統(tǒng)。我們不得不用還原論的方法把問題“切”到足夠清晰、足夠可驗(yàn)證;而這一切割必然伴隨條件簡化,甚至忽略真實(shí)世界的一部分。否則很難從物理化學(xué)層面把分子機(jī)制講清楚,更談不上開發(fā)能不斷迭代的干預(yù)手段。
AlphaFold的成功,經(jīng)常被拿來做類比:既然蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)能預(yù)測,是否能推而廣之預(yù)測更復(fù)雜的生命現(xiàn)象?我的判斷是:它更像是一個提醒。提醒我們什么樣的問題“適合被AI解決”,也提醒我們哪些問題暫時不具備同樣的條件。結(jié)構(gòu)預(yù)測之所以可行,是因?yàn)閱栴}高度約束:演化信息提供強(qiáng)監(jiān)督信號,物理化學(xué)規(guī)律在統(tǒng)計(jì)意義上穩(wěn)定,而“結(jié)構(gòu)”本身也是一個相對低維、可定義的目標(biāo)。這些條件并不天然存在于更高層級的生命現(xiàn)象中,比如細(xì)胞命運(yùn)、組織穩(wěn)態(tài)、疾病進(jìn)程,或者藥物在人體里的真實(shí)療效。
AI可以極大擴(kuò)展假設(shè)空間,提高篩選效率,甚至在很多情況下給出看似“合理”的答案,但它不能替代因果驗(yàn)證。生命科學(xué)真正困難的部分,往往不在于“有沒有相關(guān)性”,而在于“哪個因素在什么條件下是必要且充分”。這些問題最終仍需要在可控實(shí)驗(yàn)中被一一證偽。所以我更愿意把AI看作一種新的工具層,而不是新的科學(xué)范式。它會淘汰低質(zhì)量的問題、粗糙的假設(shè)和重復(fù)性的勞動,但不會自動產(chǎn)生真正有深度的科學(xué)問題。未來的小實(shí)驗(yàn)室攻關(guān)的科研未必會消失,但角色會發(fā)生變化:從大規(guī)模探索,轉(zhuǎn)向少數(shù)關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)的精準(zhǔn)驗(yàn)證;從描述現(xiàn)象,轉(zhuǎn)向界定邊界條件和因果鏈條。
在這一意義上,AI并沒有讓科學(xué)變“容易”,只是讓不嚴(yán)肅的科學(xué)更難生存。
基于這些變化,我對2025年以后的一個判斷是:以信息不對稱支撐的跨領(lǐng)域“無效科研”,空間會被迅速壓縮;AI工具會在問題提出、實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)和結(jié)果評估上被廣泛使用;會使用AI工具的同學(xué)在邁向?qū)<业穆飞铣墒斓母臁6鴮?shí)驗(yàn)科學(xué)與醫(yī)學(xué)的深度結(jié)合,將成為真正改變生命科學(xué)問題來源的那條主線。
北生所于2018年與朝陽醫(yī)院共同發(fā)起醫(yī)師科學(xué)家項(xiàng)目,讓有臨床問題、有臨床樣本的年輕醫(yī)生,通過雙向選擇,全時到北生所做兩年科研。一方面解決臨床問題,同時也不斷開拓基礎(chǔ)科學(xué)家的思路。該項(xiàng)目隨后獲得北京市衛(wèi)健委支持,并成為固定支持項(xiàng)目。我可以想象:當(dāng)科研與醫(yī)學(xué)資源被更有效地耦合,很多今天還難以成形的問題,未來會在更真實(shí)的語境里被重新定義、被拆解、被回答。并開出我們目前難以想象的花朵。
回到這一切的起點(diǎn),我越來越覺得:科學(xué)研究真正重要的并不是工具、制度或風(fēng)口,而是我們在日益浮躁的大環(huán)境下,是否還愿意為一個不確定的問題,付出確定的時間。技術(shù)會變,資源會變,評價體系也會變,但科學(xué)最終留下來的,往往不是某一次“熱鬧”的突破,而是一個系統(tǒng)是否為下一次迭代的突破,保留了可能性。
不經(jīng)意間,一群學(xué)生從身邊走過,熟悉的笑聲,陌生的面容。他們穿過NIBS的旋轉(zhuǎn)門,走出、走進(jìn)。門還在原地轉(zhuǎn),離第一次被推動,已經(jīng)二十二年了。
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