近年來,高齡父親比例不斷攀升,而科學家們發現,父親的年齡增長會提升后代出現代謝紊亂、神經精神疾病甚至行為異常的風險。這背后隱藏著怎樣的生物學秘密?
傳統研究多聚焦于精子DNA損傷或甲基化變化,但最新科學研究揭示,精子中一組曾被忽視的“信使”:小非編碼RNA(sncRNA),可能是傳遞父親年齡信息的關鍵載體。
近日,一項發表于The EMBO Journal的研究,利用突破性技術,首次在人類和小鼠精子中捕捉到了一種前所未有的“斷崖式”衰老信號。
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隨著社會發展和婚育年齡推遲,高齡父親已成為全球普遍現象。大量流行病學及動物模型研究表明,父親年齡增長與后代多種健康問題存在關聯。以往,科學家主要從精子DNA完整性和表觀遺傳修飾(如DNA甲基化)角度探索其機制。然而,近年研究發現,哺乳動物精子攜帶的豐富小非編碼RNA(包括miRNA、tsRNA、rsRNA等)及其修飾,在介導父源環境信息(包括衰老)跨代傳遞中扮演著關鍵角色,形成了獨特的“精子RNA密碼”。
但是,由于這些RNA分子上存在廣泛的化學修飾,傳統測序技術無法全面、準確地捕獲它們,導致對精子衰老過程中RNA動態變化的認識一直模糊不清。本研究旨在利用一種能克服RNA修飾檢測瓶頸的全新測序技術:PANDORA-seq,精確描繪小鼠和人類精子在整個生命周期中小非編碼RNA的全景圖譜,以期發現精子衰老的可靠生物標志物,并探究其潛在功能。
核心方法:PANDORA-seq技術突破
研究團隊采用了他們自主研發的PANDORA-seq技術。該技術的關鍵優勢在于能夠有效消除RNA修飾對測序的干擾,從而捕獲到傳統方法無法檢測到的大量tsRNA和rsRNA,真正實現了對精子小RNA組的無偏倚全景分析。
小鼠精子中的“衰老懸崖”
研究人員對不同年齡段(10至90周齡)小鼠的精子進行了分析。通過PANDORA-seq,他們發現了一個驚人的現象:在50周齡到70周齡之間,精子(尤其是精子頭部)中的tsRNA和rsRNA組成發生了劇烈而突然的轉變,形成了一個清晰的“衰老懸崖”,將早期衰老(10-50周)與晚期衰老(70-90周)截然分開。這一劇烈變化是傳統測序方法完全無法觀察到的。
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精子頭部rsRNA的長度變化:一個保守的衰老標志
更細致的分析揭示了一個獨特且關鍵的發現:隨著小鼠年齡增長,其精子頭部(而非整個精子)中rsRNA的“長度分布”發生了系統性改變:較長的rsRNA片段相對增加,而較短的片段相對減少。這種變化在來源于核糖體28S和18S rRNA的rsRNA中尤為顯著。令人驚訝的是,在精子頭部樣本中,盡管已完全去除了含有線粒體的精子尾部,研究人員仍然檢測到了線粒體來源的tsRNA和rsRNA,暗示這些RNA可能從線粒體轉運至細胞核,參與衰老的信號傳遞。
人類精子中同樣存在rsRNA長度變化
為了驗證這一發現在人類中的普遍性,研究團隊分析了兩個獨立的人類精子樣本隊列(包括縱向和橫斷面研究)。結果顯示,人類精子頭部rsRNA同樣表現出與年齡相關的長度分布變化,其趨勢與小鼠完全一致:長者增多,短者減少。這表明,rsRNA的長度變化是哺乳動物精子衰老過程中一個進化上保守的分子特征。
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衰老相關的sncRNA能重編程胚胎干細胞基因表達
這些變化的RNA分子是否具有功能?研究團隊合成了兩組分別模擬“年輕”和“年老”精子RNA特征(tsRNA和rsRNA的組合),并將其轉染到小鼠胚胎干細胞(mESCs)中。RNA測序分析發現:
1.“年老”組合顯著改變了mESCs的基因表達譜。
2.受影響的基因通路主要集中在代謝過程(如脂肪酸代謝、糖酵解)、線粒體功能(如氧化磷酸化)以及神經退行性疾病相關通路(如帕金森病、阿爾茨海默病)。
3.這些通路變化與之前報道的、由年老精子所生后代中觀察到的代謝和神經表型高度吻合。這證明,衰老精子中特定sncRNA譜的變化,具備調控早期胚胎基因表達并影響后代健康的潛在能力。
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總結
這項研究借助革命性的PANDORA-seq技術,首次繪制了精子衰老過程中小非編碼RNA的動態全景圖,并取得了多項突破性發現:
1)揭示了精子tsRNA/rsRNA組成存在“斷崖式”轉變的“衰老懸崖”;
2)發現了在小鼠和人類中均保守存在的、精子頭部rsRNA長度隨年齡增加而變化的全新生物標志物;
3)證實了模擬年老精子特征的sncRNA能夠重編程胚胎干細胞的轉錄組,影響與后代疾病相關的代謝和神經通路。
這些發現不僅為理解父親年齡影響后代健康的分子機制提供了全新視角,揭示了“精子RNA密碼”在衰老過程中的關鍵變化,更重要的是,rsRNA長度變化這一保守特征,有望開發為評估人類精子衰老和生育質量的臨床新型生物標志物。未來,進一步探索驅動這些RNA變化的源頭(如氧化應激)及具體作用機制,將有助于開發干預策略,為促進健康的跨代遺傳帶來新希望。
來源:Shi J, Zhang X, et al. Conserved shifts in sperm small non-coding RNA profiles during mouse and human aging. EMBO J. 2026 Jan 20.
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