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      發(fā)現(xiàn)一個(gè)新的生長(zhǎng)原理

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      尋找生命生長(zhǎng)的普適規(guī)律

      一個(gè)多世紀(jì)以來,生物學(xué)家一直在探尋一個(gè)問題:為什么隨著營(yíng)養(yǎng)素變得更加豐富時(shí),生物體的生長(zhǎng)速度并不會(huì)無限加速,而是會(huì)減慢,呈現(xiàn)出一種“收益遞減”的現(xiàn)象?這種現(xiàn)象在微生物、植物乃至動(dòng)物中普遍存在,卻始終缺乏一個(gè)統(tǒng)一的解釋。

      20世紀(jì)40年代,微生物學(xué)家莫諾(Jacques Monod)提出莫諾定律描述了這種現(xiàn)象。根據(jù)莫諾方程:微生物的生長(zhǎng)速率會(huì)隨營(yíng)養(yǎng)素濃度增加而上升,最終趨于飽和。然而,這一定律是否具有“普適性”,一直存在爭(zhēng)議。因?yàn)?strong>莫諾定律假設(shè),限制生長(zhǎng)的營(yíng)養(yǎng)物或生化反應(yīng)只有一種。而我們知道,細(xì)胞內(nèi)部實(shí)則存在成千上萬種相互作用的化學(xué)過程,它們都在競(jìng)爭(zhēng)同樣有限的資源。

      全局限制原理的提出

      在一項(xiàng)于近期發(fā)表在《美國(guó)國(guó)家科學(xué)院院刊》上的研究中,一個(gè)研究團(tuán)隊(duì)給出了一個(gè)新的答案:他們表示莫諾方程只揭示了問題的一角,細(xì)胞生長(zhǎng)并非由單一限制主導(dǎo),而是由多個(gè)相互作用的限制網(wǎng)絡(luò)共同塑造。

      這一新提出的微生物的全局限制原理(global constraint principle),從數(shù)學(xué)上證明了當(dāng)一種營(yíng)養(yǎng)素變得充足時(shí),其他因素——如酶的可利用性、細(xì)胞體積或膜容量——便會(huì)轉(zhuǎn)而成為新的限制。

      研究團(tuán)隊(duì)采用了一種名為“基于限制的建模”的方法來模擬細(xì)胞的資源管理過程,結(jié)果顯示:雖然增加營(yíng)養(yǎng)總能促進(jìn)生長(zhǎng),但每增加一種營(yíng)養(yǎng)素,其促進(jìn)效果都會(huì)遞減

      兩大經(jīng)典定律的結(jié)合

      這一新原理融合了兩條經(jīng)典的生物學(xué)定律,即描述微生物生長(zhǎng)的莫諾方程,以及利比希最小因子定律。利比希小因子定律指出,植物的生長(zhǎng)受最稀缺的營(yíng)養(yǎng)素(如氮或磷)所限制。換言之,即使植物擁有充足的其他營(yíng)養(yǎng)素,也只能在最短缺營(yíng)養(yǎng)素允許的范圍內(nèi)生長(zhǎng)。

      通過結(jié)合這兩種思想,研究人員提出了臺(tái)階桶模型。在這個(gè)模型中,桶的木板呈階梯狀展開,每一級(jí)臺(tái)階代表一個(gè)新的限制因素,它會(huì)隨著細(xì)胞生長(zhǎng)速度的提升而逐漸起作用。它代表隨著營(yíng)養(yǎng)素水平提高,不同的限制因素依次生效。這解釋了為何無論是微生物還是高等生物,即使補(bǔ)充更多營(yíng)養(yǎng)素,其生長(zhǎng)仍會(huì)出現(xiàn)“收益遞減”的現(xiàn)象,因?yàn)樾碌南拗埔蛩貢?huì)隨之成為主導(dǎo)。


      臺(tái)階狀利比希桶:展示“全局限制原理”概念的可視化圖像,其中不同資源的分配決定了細(xì)胞的生長(zhǎng)動(dòng)力學(xué)。(圖/J.F. Yamagishi & T.S. Hatakeyama / PNAS)

      為驗(yàn)證這一理論,研究團(tuán)隊(duì)使用了大規(guī)模的大腸桿菌(

      Escherichia coli
      )計(jì)算模型,模型中涵蓋了細(xì)胞如何利用蛋白質(zhì)、空間布局方式以及膜的容量限制。模擬結(jié)果表明,隨著營(yíng)養(yǎng)素物質(zhì)增加, 生長(zhǎng)速率確實(shí)呈現(xiàn)出預(yù)測(cè)中的放緩趨勢(shì),并揭示了氧或氮的水平如何影響生長(zhǎng)模式 。這些結(jié)果與實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)高度吻合,驗(yàn)證了模型的準(zhǔn)確性。

      邁向生命生長(zhǎng)的普適理論

      這一發(fā)現(xiàn)為研究各種生命形式的生長(zhǎng)提供了全新的視角。通過整合不同的原理,“全局限制原理”無需對(duì)每個(gè)分子進(jìn)行詳細(xì)建模,就能解釋復(fù)雜的生物學(xué)行為。這為建立生命生長(zhǎng)的普適規(guī)律奠定了基礎(chǔ)。

      這項(xiàng)研究的意義超越了基礎(chǔ)生物學(xué)范疇。它不僅可能幫助提升工業(yè)中的微生物產(chǎn)量,還能通過識(shí)別限制性營(yíng)養(yǎng)來提高作物產(chǎn)量,并為預(yù)測(cè)氣候變化下生態(tài)系統(tǒng)的響應(yīng)提供依據(jù)。

      未來,研究人員計(jì)劃將進(jìn)一步探索這一原理如何適用于不同生物,以及多種營(yíng)養(yǎng)元素如何協(xié)同作用。通過將微生物生物學(xué)與生態(tài)學(xué)理論相結(jié)合,這項(xiàng)研究向建立“生命生長(zhǎng)極限”的普適理論邁出了重要一步。

      #參考來源:

      https://www.isct.ac.jp/en/news/h32imtc2txod

      https://www.pnas.org/doi/10.1073/pnas.2515031122

      #圖片來源:

      封面圖&首圖:J.F. Yamagishi & T.S. Hatakeyama / PNAS

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